Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rnf17Q99MV7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf17Q99MV7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms