Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 YOL050CYOL050C 321 nt5.47□□□□□ -1.53
SSM4P40318 DCS2YOR173W 1062 nt5.47□□□□□ -1.53
SSM4P40318 ANT1YPR128C 987 nt5.47□□□□□ -1.53
SSM4P40318 STP22YCL008C 1158 nt5.47□□□□□ -1.53
SSM4P40318 SSM4YIL030C 3960 nt5.46□□□□□ -1.53
SSM4P40318 GAS2YLR343W 1668 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 ATG26YLR189C 3597 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 RMD1YDL001W 1293 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 MCM21YDR318W 1107 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YHP1YDR451C 1062 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 ERG26YGL001C 1050 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 RPL8AYHL033C 771 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 BNA1YJR025C 534 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 HMX1YLR205C 954 nt5.46□□□□□ -1.54
SSM4P40318 RPS14AYCR031C 414 nt5.45□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YPR015CYPR015C 744 nt5.45□□□□□ -1.54
SSM4P40318 SUE1YPR151C 621 nt5.45□□□□□ -1.54
SSM4P40318 snR32snR32 188 nt5.45□□□□□ -1.54
SSM4P40318 FDC1YDR539W 1512 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YND1YER005W 1893 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 MCM7YBR202W 2538 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 MRM2YGL136C 963 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 AIM26YKL037W 357 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 URA4YLR420W 1095 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.44□□□□□ -1.54
SSM4P40318 MCM4YPR019W 2802 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 HST1YOL068C 1512 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 RAD17YOR368W 1206 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YOL153CYOL153C 1746 nt5.43□□□□□ -1.54
SSM4P40318 NOG1YPL093W 1944 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 SAS10YDL153C 1833 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 OSW1YOR255W 837 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 ZRC1YMR243C 1329 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 FPK1YNR047W 2682 nt5.42□□□□□ -1.54
SSM4P40318 KCH1YJR054W 1494 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 VMA1YDL185W 3216 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 DAN1YJR150C 897 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 ELF1YKL160W 438 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 YKR047WYKR047W 306 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 SUI3YPL237W 858 nt5.41□□□□□ -1.54
SSM4P40318 PHO87YCR037C 2772 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 LDB17YDL146W 1476 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 MPH2YDL247W 1830 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ARX1YDR101C 1782 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YDR249CYDR249C 1122 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YDR282CYDR282C 1245 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 SEM1YDR363W-A 270 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 IES6YEL044W 501 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 MUP3YHL036W 1641 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 HLJ1YMR161W 675 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 LTO1YNL260C 597 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 MIS1YBR084W 2928 nt5.4□□□□□ -1.55
SSM4P40318 GAL11YOL051W 3246 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YGR122WYGR122W 1209 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ARD1YHR013C 717 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 REX3YLR107W 1215 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 SWH1YAR042W 3567 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 BUD14YAR014C 2130 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 NOC2YOR206W 2133 nt5.39□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ECM32YER176W 3366 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YDL109CYDL109C 1944 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 STR2YJR130C 1920 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YGL101WYGL101W 648 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 MRT4YKL009W 711 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YNL234WYNL234W 1281 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 POF1YCL047C 777 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 BDP1YNL039W 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
SSM4P40318 UBA2YDR390C 1911 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 SEO1YAL067C 1782 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 HSP42YDR171W 1128 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ZRT1YGL255W 1131 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ECM16YMR128W 3804 nt5.37□□□□□ -1.55
SSM4P40318 TMN2YDR107C 2019 nt5.36□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YDL071CYDL071C 375 nt5.36□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YEL074WYEL074W 339 nt5.36□□□□□ -1.55
SSM4P40318 NAT3YPR131C 588 nt5.36□□□□□ -1.55
SSM4P40318 GRC3YLL035W 1899 nt5.36□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YPL260WYPL260W 1656 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 PMT5YDL093W 2232 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 ERG5YMR015C 1617 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 VAC7YNL054W 3498 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 RPS0AYGR214W 759 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 LNP1YHR192W 837 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 RPB3YIL021W 957 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 GVP36YIL041W 981 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YLR326WYLR326W 723 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 POS5YPL188W 1245 nt5.35□□□□□ -1.55
SSM4P40318 RAD53YPL153C 2466 nt5.34□□□□□ -1.55
SSM4P40318 YER085CYER085C 522 nt5.34□□□□□ -1.55
SSM4P40318 MHO1YJR008W 1017 nt5.34□□□□□ -1.55
SSM4P40318 SEG2YKL105C 3399 nt5.34□□□□□ -1.55
SSM4P40318 JEN1YKL217W 1851 nt5.34□□□□□ -1.55
SSM4P40318 RPB2YOR151C 3675 nt5.34□□□□□ -1.55
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