Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3KBP1Q96B97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3KBP1Q96B97 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms