Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YKR047W	YKR047W	306 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SKG1	YKR100C	1068 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	BUD17	YNR027W	954 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	REG2	YBR050C	1017 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	OPY2	YPR075C	1083 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.94	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	MRT4	YKL009W	711 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SPS19	YNL202W	879 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	PCL1	YNL289W	840 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ECM23	YPL021W	564 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	PEP4	YPL154C	1218 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.93	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SPT3	YDR392W	1014 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	CYC1	YJR048W	330 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	DAN1	YJR150C	897 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	COG5	YNL051W	1212 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YPR015C	YPR015C	744 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	REI1	YBR267W	1182 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.92	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	PRM2	YIL037C	1971 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	MUP3	YHL036W	1641 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	KIN28	YDL108W	921 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YGR273C	YGR273C	525 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	COA3	YJL062W-A	258 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	BSD2	YBR290W	966 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	YER158C	YER158C	1722 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.91	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	TCM62	YBR044C	1719 nt		4.9	□□□□□ -1.62
RPC53	P25441	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YNK1	YKL067W	462 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YPR071W	YPR071W	636 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.9	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	DAS2	YDR020C	699 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YND1	YER005W	1893 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	CNA1	YLR433C	1662 nt		4.89	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	NAT2	YGR147C	867 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	GPP1	YIL053W	753 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	TGS1	YPL157W	948 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	ICY2	YPL250C	411 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	TIF5	YPR041W	1218 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	CKS1	YBR135W	453 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	CEG1	YGL130W	1380 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	OAF1	YAL051W	3144 nt		4.88	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	DPH6	YLR143W	2058 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	LSO1	YJR005C-A	282 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	ACP1	YKL192C	378 nt		4.87	□□□□□ -1.63
RPC53	P25441	NMD4	YLR363C	657 nt		4.87	□□□□□ -1.63

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