Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRR1P24046 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRR1P24046 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms