Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn13Q9Z0S4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn13Q9Z0S4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn13Q9Z0S4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn13Q9Z0S4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn13Q9Z0S4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn13Q9Z0S4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn13Q9Z0S4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn13Q9Z0S4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn13Q9Z0S4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn13Q9Z0S4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn13Q9Z0S4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn13Q9Z0S4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn13Q9Z0S4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms