Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cldn13Q9Z0S4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cldn13Q9Z0S4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cldn13Q9Z0S4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cldn13Q9Z0S4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cldn13Q9Z0S4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cldn13Q9Z0S4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cldn13Q9Z0S4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cldn13Q9Z0S4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cldn13Q9Z0S4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn13Q9Z0S4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cldn13Q9Z0S4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn13Q9Z0S4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cldn13Q9Z0S4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cldn13Q9Z0S4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cldn13Q9Z0S4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cldn13Q9Z0S4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cldn13Q9Z0S4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cldn13Q9Z0S4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cldn13Q9Z0S4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cldn13Q9Z0S4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn13Q9Z0S4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cldn13Q9Z0S4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn13Q9Z0S4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cldn13Q9Z0S4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cldn13Q9Z0S4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cldn13Q9Z0S4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cldn13Q9Z0S4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cldn13Q9Z0S4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cldn13Q9Z0S4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cldn13Q9Z0S4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cldn13Q9Z0S4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn13Q9Z0S4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn13Q9Z0S4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn13Q9Z0S4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cldn13Q9Z0S4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn13Q9Z0S4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn13Q9Z0S4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn13Q9Z0S4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn13Q9Z0S4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn13Q9Z0S4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Cldn13Q9Z0S4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn13Q9Z0S4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn13Q9Z0S4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn13Q9Z0S4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn13Q9Z0S4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cldn13Q9Z0S4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn13Q9Z0S4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn13Q9Z0S4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn13Q9Z0S4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn13Q9Z0S4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldn13Q9Z0S4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn13Q9Z0S4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn13Q9Z0S4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cldn13Q9Z0S4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn13Q9Z0S4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn13Q9Z0S4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn13Q9Z0S4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn13Q9Z0S4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn13Q9Z0S4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cldn13Q9Z0S4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn13Q9Z0S4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn13Q9Z0S4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn13Q9Z0S4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn13Q9Z0S4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cldn13Q9Z0S4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn13Q9Z0S4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn13Q9Z0S4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn13Q9Z0S4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn13Q9Z0S4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn13Q9Z0S4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn13Q9Z0S4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn13Q9Z0S4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cldn13Q9Z0S4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn13Q9Z0S4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cldn13Q9Z0S4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cldn13Q9Z0S4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cldn13Q9Z0S4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn13Q9Z0S4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn13Q9Z0S4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cldn13Q9Z0S4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cldn13Q9Z0S4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms