Protein–RNA interactions for Protein: Q06139

YLR346C, Uncharacterized protein YLR346C, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR346CQ06139 YCL042WYCL042W 360 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR346CQ06139 SWE1YJL187C 2460 nt10.21□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 Q0255Q0255 1419 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 SKG1YKR100C 1068 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 FMP45YDL222C 930 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 SOR2YDL246C 1074 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 YGL188CYGL188C 174 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 SOR1YJR159W 1074 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 ERF2YLR246W 1080 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 MXR2YCL033C 507 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR346CQ06139 YIH1YCR059C 777 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 YKR040CYKR040C 504 nt10.13□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 YPR011CYPR011C 981 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 ERV46YAL042W 1248 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 CRR1YLR213C 1269 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 RNQ1YCL028W 1218 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 YLL053CYLL053C 459 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 YOR169CYOR169C 465 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 YPL071CYPL071C 471 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR346CQ06139 ATP6Q0085 780 nt10.07□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 URE2YNL229C 1065 nt10.06□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 HEM12YDR047W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 YFL067WYFL067W 528 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 AIR1YIL079C 1083 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 FRD1YEL047C 1413 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 NEM1YHR004C 1341 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 URH1YDR400W 1023 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 LPX1YOR084W 1164 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 KTR3YBR205W 1215 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 HSP60YLR259C 1719 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR346CQ06139 ATF2YGR177C 1608 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 RAX1YOR301W 1308 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 YPL168WYPL168W 1293 nt10□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 GLK1YCL040W 1503 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 FTR1YER145C 1215 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 HMT1YBR034C 1047 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.98□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 SNG1YGR197C 1644 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 DDR2YOL052C-A 186 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR346CQ06139 MIC10YCL057C-A 294 nt9.96□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 YJL118WYJL118W 660 nt9.95□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 GAL1YBR020W 1587 nt9.95□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 TRM5YHR070W 1500 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 DIC1YLR348C 897 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 FUR4YBR021W 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.92□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 CCA1YER168C 1641 nt9.9□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 AQY1YPR192W 918 nt9.9□□□□□ -0.82
YLR346CQ06139 BNA2YJR078W 1362 nt9.88□□□□□ -0.83
YLR346CQ06139 ALG12YNR030W 1656 nt9.87□□□□□ -0.83
YLR346CQ06139 YHM2YMR241W 945 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR346CQ06139 STD1YOR047C 1335 nt9.85□□□□□ -0.83
YLR346CQ06139 ANP1YEL036C 1503 nt9.85□□□□□ -0.83
YLR346CQ06139 PRP4YPR178W 1398 nt9.82□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 LSM12YHR121W 564 nt9.81□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 YEL076CYEL076C 651 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 SPC25YER018C 666 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 YLR235CYLR235C 399 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 YLR464WYLR464W 651 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 STB1YNL309W 1263 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 PHO92YDR374C 921 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 MIC12YBR262C 321 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 UME6YDR207C 2511 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.78□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 FEN2YCR028C 1539 nt9.77□□□□□ -0.84
YLR346CQ06139 THP3YPR045C 1413 nt9.77□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 TIM23YNR017W 669 nt9.77□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 AAC1YMR056C 930 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 GPI16YHR188C 1833 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 DPS1YLL018C 1674 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 PTH1YHR189W 573 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 BMT6YLR063W 1098 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 YLR179CYLR179C 606 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.74□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 WSC2YNL283C 1512 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 AST1YBL069W 1290 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 HHO1YPL127C 777 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR346CQ06139 YEL074WYEL074W 339 nt9.71□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 DUS1YML080W 1272 nt9.71□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YCL074WYCL074W 927 nt9.7□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YIR016WYIR016W 798 nt9.7□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YKR005CYKR005C 1578 nt9.69□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YJL107CYJL107C 1164 nt9.68□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 CCT4YDL143W 1587 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 AGP1YCL025C 1902 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 AHT1YHR093W 549 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 VPS60YDR486C 690 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YGR201CYGR201C 678 nt9.65□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YHL044WYHL044W 708 nt9.65□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 SPP1YPL138C 1062 nt9.65□□□□□ -0.86
YLR346CQ06139 YKL030WYKL030W 606 nt9.64□□□□□ -0.87
YLR346CQ06139 MOD5YOR274W 1287 nt9.64□□□□□ -0.87
YLR346CQ06139 MCH5YOR306C 1566 nt9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms