Protein–RNA interactions for Protein: Q05947

YLR224W, F-box protein YLR224W, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR224WQ05947 HSL7YBR133C 2484 nt9.44□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 SOR2YDL246C 1074 nt9.43□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 YFL067WYFL067W 528 nt9.43□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 SOR1YJR159W 1074 nt9.43□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 YCL074WYCL074W 927 nt9.42□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 RNQ1YCL028W 1218 nt9.42□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 IMP2'YIL154C 1041 nt9.41□□□□□ -0.9
YLR224WQ05947 AGP1YCL025C 1902 nt9.39□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 PUS2YGL063W 1113 nt9.38□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 DUS1YML080W 1272 nt9.38□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 YDR433WYDR433W 441 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 YAT1YAR035W 2064 nt9.36□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 FTR1YER145C 1215 nt9.36□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 MXR2YCL033C 507 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 YCL042WYCL042W 360 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 TRM5YHR070W 1500 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 BNA2YJR078W 1362 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR224WQ05947 DDR2YOL052C-A 186 nt9.33□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 GAL1YBR020W 1587 nt9.33□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 FMP45YDL222C 930 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 MIC12YBR262C 321 nt9.32□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 NDI1YML120C 1542 nt9.31□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 YPR011CYPR011C 981 nt9.31□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 ANP1YEL036C 1503 nt9.3□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.29□□□□□ -0.92
YLR224WQ05947 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 ERV46YAL042W 1248 nt9.23□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 YKR040CYKR040C 504 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 LPX1YOR084W 1164 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 HHO1YPL127C 777 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR224WQ05947 FRD1YEL047C 1413 nt9.21□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 DIC1YLR348C 897 nt9.2□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 STR3YGL184C 1398 nt9.19□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 SPT20YOL148C 1815 nt9.19□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 XDJ1YLR090W 1380 nt9.18□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 HEL2YDR266C 1920 nt9.16□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 PAU21YOR394W 495 nt9.15□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 PAU22YPL282C 495 nt9.15□□□□□ -0.94
YLR224WQ05947 FEN2YCR028C 1539 nt9.15□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 AQY1YPR192W 918 nt9.14□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.13□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 STB1YNL309W 1263 nt9.13□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 SPC25YER018C 666 nt9.11□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 RPC82YPR190C 1965 nt9.1□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 YGR201CYGR201C 678 nt9.1□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 DUT1YBR252W 444 nt9.1□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 RTN2YDL204W 1182 nt9.09□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 YIR016WYIR016W 798 nt9.09□□□□□ -0.95
YLR224WQ05947 ARO7YPR060C 771 nt9.08□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 INA1YLR413W 2028 nt9.08□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 AQY2YLL052C 450 nt9.07□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 GDH3YAL062W 1374 nt9.07□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 GPI16YHR188C 1833 nt9.06□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 RIM8YGL045W 1629 nt9.03□□□□□ -0.96
YLR224WQ05947 VPS60YDR486C 690 nt9.01□□□□□ -0.97
YLR224WQ05947 HIF1YLL022C 1158 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR224WQ05947 ALG3YBL082C 1377 nt8.98□□□□□ -0.97
YLR224WQ05947 YGL114WYGL114W 2178 nt8.97□□□□□ -0.97
YLR224WQ05947 CCT4YDL143W 1587 nt8.96□□□□□ -0.97
YLR224WQ05947 PTH1YHR189W 573 nt8.95□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 GOR1YNL274C 1053 nt8.95□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 AVT6YER119C 1347 nt8.95□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 MET8YBR213W 825 nt8.94□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 MUP1YGR055W 1725 nt8.94□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 ALD4YOR374W 1560 nt8.92□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 YLR235CYLR235C 399 nt8.91□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 TIM23YNR017W 669 nt8.91□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 YLR179CYLR179C 606 nt8.9□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 SPP1YPL138C 1062 nt8.9□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 SWC5YBR231C 912 nt8.9□□□□□ -0.98
YLR224WQ05947 PRM5YIL117C 957 nt8.88□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 PLB1YMR008C 1995 nt8.87□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 MAE1YKL029C 2010 nt8.86□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 AHT1YHR093W 549 nt8.85□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 HOL1YNR055C 1761 nt8.84□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 CLB6YGR109C 1143 nt8.84□□□□□ -0.99
YLR224WQ05947 ARP6YLR085C 1317 nt8.8□□□□□ -1
YLR224WQ05947 ZRT3YKL175W 1512 nt8.79□□□□□ -1
YLR224WQ05947 YKL030WYKL030W 606 nt8.78□□□□□ -1
YLR224WQ05947 YPR064WYPR064W 420 nt8.75□□□□□ -1.01
YLR224WQ05947 REG2YBR050C 1017 nt8.74□□□□□ -1.01
YLR224WQ05947 MET2YNL277W 1461 nt8.72□□□□□ -1.01
YLR224WQ05947 NBP35YGL091C 987 nt8.72□□□□□ -1.01
YLR224WQ05947 YJL067WYJL067W 351 nt8.72□□□□□ -1.01
YLR224WQ05947 UTR1YJR049C 1593 nt8.71□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 DAT1YML113W 747 nt8.71□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 ACO2YJL200C 2370 nt8.71□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 SHM2YLR058C 1410 nt8.7□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 PAM17YKR065C 594 nt8.69□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 TAD3YLR316C 969 nt8.69□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 YNL024CYNL024C 741 nt8.69□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 ILV3YJR016C 1758 nt8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms