Protein–RNA interactions for Protein: P32863

RAD54, DNA repair and recombination protein RAD54, yeastyeast

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAD54P32863 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.21□□□□□ -0.45
RAD54P32863 SNF6YHL025W 999 nt12.19□□□□□ -0.46
RAD54P32863 YLR235CYLR235C 399 nt12.17□□□□□ -0.46
RAD54P32863 YKL030WYKL030W 606 nt12.15□□□□□ -0.46
RAD54P32863 LCB1YMR296C 1677 nt12.15□□□□□ -0.46
RAD54P32863 PIB2YGL023C 1908 nt12.15□□□□□ -0.46
RAD54P32863 YDR094WYDR094W 336 nt12.14□□□□□ -0.47
RAD54P32863 PET20YPL159C 762 nt12.13□□□□□ -0.47
RAD54P32863 RTF1YGL244W 1677 nt12.13□□□□□ -0.47
RAD54P32863 YCR099CYCR099C 468 nt12.12□□□□□ -0.47
RAD54P32863 SIM1YIL123W 1431 nt12.11□□□□□ -0.47
RAD54P32863 NCP1YHR042W 2076 nt12.09□□□□□ -0.47
RAD54P32863 HMT1YBR034C 1047 nt12.09□□□□□ -0.47
RAD54P32863 BOP3YNL042W 1191 nt12.08□□□□□ -0.48
RAD54P32863 YJL118WYJL118W 660 nt12.07□□□□□ -0.48
RAD54P32863 BIO4YNR057C 714 nt12.07□□□□□ -0.48
RAD54P32863 YPL071CYPL071C 471 nt12.06□□□□□ -0.48
RAD54P32863 YIH1YCR059C 777 nt12.04□□□□□ -0.48
RAD54P32863 snR78snR78 87 nt12.03□□□□□ -0.48
RAD54P32863 SKG1YKR100C 1068 nt12.03□□□□□ -0.48
RAD54P32863 DIC1YLR348C 897 nt12.03□□□□□ -0.48
RAD54P32863 RNQ1YCL028W 1218 nt12.01□□□□□ -0.49
RAD54P32863 AI3Q0060 1248 nt11.99□□□□□ -0.49
RAD54P32863 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.99□□□□□ -0.49
RAD54P32863 YLL053CYLL053C 459 nt11.97□□□□□ -0.49
RAD54P32863 TIM23YNR017W 669 nt11.95□□□□□ -0.5
RAD54P32863 PTK1YKL198C 1989 nt11.94□□□□□ -0.5
RAD54P32863 YHM2YMR241W 945 nt11.93□□□□□ -0.5
RAD54P32863 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.91□□□□□ -0.5
RAD54P32863 YNR068CYNR068C 819 nt11.88□□□□□ -0.51
RAD54P32863 LYS4YDR234W 2082 nt11.87□□□□□ -0.51
RAD54P32863 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.87□□□□□ -0.51
RAD54P32863 YLR179CYLR179C 606 nt11.87□□□□□ -0.51
RAD54P32863 FTR1YER145C 1215 nt11.86□□□□□ -0.51
RAD54P32863 ERF2YLR246W 1080 nt11.86□□□□□ -0.51
RAD54P32863 GAL1YBR020W 1587 nt11.84□□□□□ -0.51
RAD54P32863 YJR154WYJR154W 1041 nt11.83□□□□□ -0.52
RAD54P32863 CRR1YLR213C 1269 nt11.83□□□□□ -0.52
RAD54P32863 ATF2YGR177C 1608 nt11.82□□□□□ -0.52
RAD54P32863 TRM5YHR070W 1500 nt11.82□□□□□ -0.52
RAD54P32863 YPR064WYPR064W 420 nt11.82□□□□□ -0.52
RAD54P32863 YFR018CYFR018C 1092 nt11.78□□□□□ -0.52
RAD54P32863 YFL054CYFL054C 1941 nt11.76□□□□□ -0.53
RAD54P32863 RRT5YFR032C 870 nt11.76□□□□□ -0.53
RAD54P32863 PAU16YKL224C 372 nt11.75□□□□□ -0.53
RAD54P32863 TAD3YLR316C 969 nt11.75□□□□□ -0.53
RAD54P32863 AQY1YPR192W 918 nt11.75□□□□□ -0.53
RAD54P32863 WSC2YNL283C 1512 nt11.75□□□□□ -0.53
RAD54P32863 YFL067WYFL067W 528 nt11.74□□□□□ -0.53
RAD54P32863 DDR2YOL052C-A 186 nt11.74□□□□□ -0.53
RAD54P32863 MIC10YCL057C-A 294 nt11.73□□□□□ -0.53
RAD54P32863 URE2YNL229C 1065 nt11.72□□□□□ -0.53
RAD54P32863 YPL168WYPL168W 1293 nt11.72□□□□□ -0.53
RAD54P32863 HEM12YDR047W 1089 nt11.71□□□□□ -0.53
RAD54P32863 AHT1YHR093W 549 nt11.71□□□□□ -0.53
RAD54P32863 SNG1YGR197C 1644 nt11.71□□□□□ -0.54
RAD54P32863 PRE6YOL038W 765 nt11.69□□□□□ -0.54
RAD54P32863 STB1YNL309W 1263 nt11.68□□□□□ -0.54
RAD54P32863 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.67□□□□□ -0.54
RAD54P32863 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.67□□□□□ -0.54
RAD54P32863 YPL041CYPL041C 624 nt11.67□□□□□ -0.54
RAD54P32863 SPC25YER018C 666 nt11.65□□□□□ -0.54
RAD54P32863 FTH1YBR207W 1398 nt11.65□□□□□ -0.55
RAD54P32863 SPT8YLR055C 1809 nt11.63□□□□□ -0.55
RAD54P32863 ANP1YEL036C 1503 nt11.63□□□□□ -0.55
RAD54P32863 YJL107CYJL107C 1164 nt11.62□□□□□ -0.55
RAD54P32863 PAB1YER165W 1734 nt11.62□□□□□ -0.55
RAD54P32863 GPI16YHR188C 1833 nt11.61□□□□□ -0.55
RAD54P32863 COG1YGL223C 1254 nt11.61□□□□□ -0.55
RAD54P32863 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.61□□□□□ -0.55
RAD54P32863 CCT4YDL143W 1587 nt11.6□□□□□ -0.55
RAD54P32863 Q0142Q0142 177 nt11.59□□□□□ -0.55
RAD54P32863 VPS60YDR486C 690 nt11.58□□□□□ -0.56
RAD54P32863 FEN2YCR028C 1539 nt11.58□□□□□ -0.56
RAD54P32863 THP3YPR045C 1413 nt11.58□□□□□ -0.56
RAD54P32863 YFL066CYFL066C 1179 nt11.56□□□□□ -0.56
RAD54P32863 PEX25YPL112C 1185 nt11.56□□□□□ -0.56
RAD54P32863 SBA1YKL117W 651 nt11.55□□□□□ -0.56
RAD54P32863 SWC5YBR231C 912 nt11.55□□□□□ -0.56
RAD54P32863 ALG3YBL082C 1377 nt11.54□□□□□ -0.56
RAD54P32863 PAC11YDR488C 1602 nt11.53□□□□□ -0.56
RAD54P32863 YLR415CYLR415C 339 nt11.52□□□□□ -0.57
RAD54P32863 BDH1YAL060W 1149 nt11.51□□□□□ -0.57
RAD54P32863 RAX1YOR301W 1308 nt11.51□□□□□ -0.57
RAD54P32863 RSM23YGL129C 1353 nt11.51□□□□□ -0.57
RAD54P32863 YEL074WYEL074W 339 nt11.5□□□□□ -0.57
RAD54P32863 SWE1YJL187C 2460 nt11.49□□□□□ -0.57
RAD54P32863 YSP3YOR003W 1437 nt11.49□□□□□ -0.57
RAD54P32863 YNL115CYNL115C 1935 nt11.48□□□□□ -0.57
RAD54P32863 BNA2YJR078W 1362 nt11.47□□□□□ -0.57
RAD54P32863 YIR016WYIR016W 798 nt11.47□□□□□ -0.57
RAD54P32863 NAT4YMR069W 858 nt11.47□□□□□ -0.57
RAD54P32863 LSM12YHR121W 564 nt11.46□□□□□ -0.57
RAD54P32863 BNS1YGR230W 414 nt11.44□□□□□ -0.58
RAD54P32863 GLK1YCL040W 1503 nt11.42□□□□□ -0.58
RAD54P32863 MIC12YBR262C 321 nt11.42□□□□□ -0.58
RAD54P32863 YGL118CYGL118C 438 nt11.41□□□□□ -0.58
RAD54P32863 AIR1YIL079C 1083 nt11.41□□□□□ -0.58
RAD54P32863 YTH1YPR107C 627 nt11.41□□□□□ -0.58
RAD54P32863 Q0255Q0255 1419 nt11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms