Protein–RNA interactions for Protein: D3YZF7

Vsig10l, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10lD3YZF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vsig10lD3YZF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vsig10lD3YZF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vsig10lD3YZF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vsig10lD3YZF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vsig10lD3YZF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vsig10lD3YZF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vsig10lD3YZF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vsig10lD3YZF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vsig10lD3YZF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vsig10lD3YZF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vsig10lD3YZF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vsig10lD3YZF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vsig10lD3YZF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vsig10lD3YZF7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsig10lD3YZF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsig10lD3YZF7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsig10lD3YZF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vsig10lD3YZF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vsig10lD3YZF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsig10lD3YZF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vsig10lD3YZF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsig10lD3YZF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsig10lD3YZF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsig10lD3YZF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsig10lD3YZF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsig10lD3YZF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsig10lD3YZF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsig10lD3YZF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vsig10lD3YZF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms