Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC6Q9Y210 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRPC6Q9Y210 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRPC6Q9Y210 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms