Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 YGR293CYGR293C 462 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 NMA1YLR328W 1206 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 RPS3YNL178W 723 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 COS1YNL336W 1146 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 SGT1YOR057W 1188 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 SCO1YBR037C 888 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 OPI11YPR044C 354 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 ECM31YBR176W 939 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 MRPS5YBR251W 924 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 YBR300CYBR300C 498 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 SGF73YGL066W 1974 nt6.85□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 FAR10YLR238W 1437 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 MSS51YLR203C 1311 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 MDH3YDL078C 1032 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 HTD2YHR067W 843 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 MTW1YAL034W-A 870 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 HMS2YJR147W 1077 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 CCP1YKR066C 1086 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 ICT1YLR099C 1185 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 AAD15YOL165C 432 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 PRM3YPL192C 402 nt6.84□□□□□ -1.31
SRF1Q12516 COQ6YGR255C 1440 nt6.84□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 IDS2YJL146W 1410 nt6.84□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 NOC4YPR144C 1659 nt6.84□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 HSV2YGR223C 1347 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SEC18YBR080C 2277 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 CTF3YLR381W 2202 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MGT1YDL200C 567 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YAP3YHL009C 993 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MDE1YJR024C 735 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 CYC1YJR048W 330 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 NPA3YJR072C 1158 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YNL296WYNL296W 315 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YNR040WYNR040W 771 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SPR2YOR214C 711 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 HXT9YJL219W 1704 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 TPO3YPR156C 1869 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 IRS4YKR019C 1848 nt6.83□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SAG1YJR004C 1953 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SLM5YCR024C 1479 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 COX9YDL067C 180 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 NPY1YGL067W 1155 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RPL24BYGR148C 468 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ILM1YJR118C 612 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SFH1YLR321C 1281 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ETR1YBR026C 1143 nt6.82□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YJR015WYJR015W 1533 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 NUP42YDR192C 1293 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SRB7YDR308C 423 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ASP1YDR321W 1146 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 BRR6YGL247W 594 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YGR126WYGR126W 693 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RPC17YJL011C 486 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 CDC73YLR418C 1182 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RRG9YNL213C 645 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ARF3YOR094W 552 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YOR263CYOR263C 408 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MRPL40YPL173W 894 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 PUT1YLR142W 1431 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SET4YJL105W 1683 nt6.81□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RPT2YDL007W 1314 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 DAL4YIR028W 1908 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 Q0092Q0092 141 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YGR079WYGR079W 1113 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 COX6YHR051W 447 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 PHO12YHR215W 1404 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 LDS1YAL018C 978 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YJR141WYJR141W 1044 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 VMA5YKL080W 1179 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 GCN3YKR026C 918 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 PHO11YAR071W 1404 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 TYE7YOR344C 876 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YSY6YBR162W-A 198 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 PRP2YNR011C 2631 nt6.8□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ATR1YML116W 1629 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YDL186WYDL186W 834 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 COS12YGL263W 1143 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 TYS1YGR185C 1185 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MTD1YKR080W 963 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 BOS1YLR078C 735 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RNA1YMR235C 1224 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 IZH2YOL002C 954 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 RER2YBR002C 861 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 MUM2YBR057C 1101 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YIL108WYIL108W 2091 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SIT1YEL065W 1887 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 STP4YDL048C 1473 nt6.79□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 BDF2YDL070W 1917 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 ITR1YDR497C 1755 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 SOG2YOR353C 2376 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YGR290WYGR290W 444 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 IRC21YMR073C 606 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 DDR48YMR173W 1293 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YMR253CYMR253C 1245 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 YNL203CYNL203C 612 nt6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms