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Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
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256 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
HXT3
YDR345C
1704 nt
5.5
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
JIP4
YDR475C
2631 nt
5.5
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
SHM1
YBR263W
1473 nt
5.5
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YFR032C-B
YFR032C-B
264 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
RPS2
YGL123W
765 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YGL132W
YGL132W
336 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YGR111W
YGR111W
1203 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MRPS35
YGR165W
1038 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
AIM19
YIL087C
474 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
AIM22
YJL046W
1230 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
BAT2
YJR148W
1131 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
STM1
YLR150W
822 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
PIN2
YOR104W
849 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
VMA4
YOR332W
702 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
RPN7
YPR108W
1290 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
BNA5
YLR231C
1362 nt
5.49
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
DEG1
YFL001W
1329 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YNR066C
YNR066C
1311 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
IMA5
YJL216C
1746 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
ADY2
YCR010C
852 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YDL016C
YDL016C
303 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YDR154C
YDR154C
351 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MPO1
YGL010W
525 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YGR026W
YGR026W
837 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
PPX1
YHR201C
1194 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
EFM4
YIL064W
774 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
HSP150
YJL159W
1242 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
TIS11
YLR136C
858 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
TAL1
YLR354C
1008 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
GMC2
YLR445W
567 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MAC1
YMR021C
1254 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
DUG3
YNL191W
1074 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YOR283W
YOR283W
693 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YBR124W
YBR124W
360 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YCL001W-A
YCL001W-A
462 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
GUF1
YLR289W
1938 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
SPS2
YDR522C
1509 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MRS2
YOR334W
1413 nt
5.48
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
KNS1
YLL019C
2214 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
CRD1
YDL142C
852 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
BUD30
YDL151C
582 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
AIR2
YDL175C
1035 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
YER148W-A
YER148W-A
579 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
HTD2
YHR067W
843 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MBR1
YKL093W
1020 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
SPS19
YNL202W
879 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
HNT3
YOR258W
654 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
SCD6
YPR129W
1050 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
MRE11
YMR224C
2079 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
UGO1
YDR470C
1509 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
HOS1
YPR068C
1413 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
HIS7
YBR248C
1659 nt
5.47
□□□□□ -1.53
ROT1
Q03691
IWR1
YDL115C
1062 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YER010C
YER010C
705 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CKA1
YIL035C
1119 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YKR047W
YKR047W
306 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
ECM30
YLR436C
3825 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YML131W
YML131W
1098 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YNL162W-A
YNL162W-A
219 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
SUR1
YPL057C
1149 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
DIM1
YPL266W
957 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
ART10
YLR392C
1557 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YNL011C
YNL011C
1335 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
HMS1
YOR032C
1305 nt
5.46
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
QNS1
YHR074W
2145 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
RAD57
YDR004W
1383 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
HSP78
YDR258C
2436 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
STE12
YHR084W
2067 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CPR4
YCR069W
957 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
RPL24B
YGR148C
468 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YJL218W
YJL218W
591 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
NYV1
YLR093C
762 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
GSP1
YLR293C
660 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CDC73
YLR418C
1182 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
RRP7
YCL031C
894 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
RNY1
YPL123C
1305 nt
5.45
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
GAS2
YLR343W
1668 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
ATC1
YDR184C
885 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
COS4
YFL062W
1140 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CWC23
YGL128C
852 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
GPA1
YHR005C
1419 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YHR069C-A
YHR069C-A
363 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YHR095W
YHR095W
495 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
SOL3
YHR163W
750 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CAB2
YIL083C
1098 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
RFC2
YJR068W
1062 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
ATG38
YLR211C
681 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
REC102
YLR329W
795 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
ARA1
YBR149W
1035 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YME1
YPR024W
2244 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
CIK1
YMR198W
1785 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
GSH2
YOL049W
1476 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YDR098C-A
YDR098C-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YDR210C-C
YDR210C-C
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YDR261C-C
YDR261C-C
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YDR316W-A
YDR316W-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YDR365W-A
YDR365W-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YER137C-A
YER137C-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YER159C-A
YER159C-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
ROT1
Q03691
YGR027W-A
YGR027W-A
1323 nt
5.44
□□□□□ -1.54
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