Protein–RNA interactions for Protein: Q03691

ROT1, Protein ROT1, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT1Q03691 HXT3YDR345C 1704 nt5.5□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 JIP4YDR475C 2631 nt5.5□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 SHM1YBR263W 1473 nt5.5□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 RPS2YGL123W 765 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YGL132WYGL132W 336 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YGR111WYGR111W 1203 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MRPS35YGR165W 1038 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 AIM19YIL087C 474 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 AIM22YJL046W 1230 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 BAT2YJR148W 1131 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 STM1YLR150W 822 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 PIN2YOR104W 849 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 VMA4YOR332W 702 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 RPN7YPR108W 1290 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 BNA5YLR231C 1362 nt5.49□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 DEG1YFL001W 1329 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YNR066CYNR066C 1311 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 IMA5YJL216C 1746 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 ADY2YCR010C 852 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YDL016CYDL016C 303 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YDR154CYDR154C 351 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MPO1YGL010W 525 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YGR026WYGR026W 837 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 PPX1YHR201C 1194 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 EFM4YIL064W 774 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 HSP150YJL159W 1242 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 TIS11YLR136C 858 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 TAL1YLR354C 1008 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 GMC2YLR445W 567 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MAC1YMR021C 1254 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 DUG3YNL191W 1074 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YOR283WYOR283W 693 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YBR124WYBR124W 360 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 GUF1YLR289W 1938 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 SPS2YDR522C 1509 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MRS2YOR334W 1413 nt5.48□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 KNS1YLL019C 2214 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 CRD1YDL142C 852 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 BUD30YDL151C 582 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 AIR2YDL175C 1035 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 HTD2YHR067W 843 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MBR1YKL093W 1020 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 SPS19YNL202W 879 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 HNT3YOR258W 654 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 SCD6YPR129W 1050 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 MRE11YMR224C 2079 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 UGO1YDR470C 1509 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 HOS1YPR068C 1413 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 HIS7YBR248C 1659 nt5.47□□□□□ -1.53
ROT1Q03691 IWR1YDL115C 1062 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YER010CYER010C 705 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CKA1YIL035C 1119 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YKR047WYKR047W 306 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ECM30YLR436C 3825 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YML131WYML131W 1098 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 SUR1YPL057C 1149 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 DIM1YPL266W 957 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ART10YLR392C 1557 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YNL011CYNL011C 1335 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 HMS1YOR032C 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 QNS1YHR074W 2145 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RAD57YDR004W 1383 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 HSP78YDR258C 2436 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 STE12YHR084W 2067 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CPR4YCR069W 957 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RPL24BYGR148C 468 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YJL218WYJL218W 591 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 NYV1YLR093C 762 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GSP1YLR293C 660 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CDC73YLR418C 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RRP7YCL031C 894 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RNY1YPL123C 1305 nt5.45□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GAS2YLR343W 1668 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ATC1YDR184C 885 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 COS4YFL062W 1140 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CWC23YGL128C 852 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GPA1YHR005C 1419 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YHR095WYHR095W 495 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 SOL3YHR163W 750 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CAB2YIL083C 1098 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 RFC2YJR068W 1062 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ATG38YLR211C 681 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 REC102YLR329W 795 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 ARA1YBR149W 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YME1YPR024W 2244 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 CIK1YMR198W 1785 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 GSH2YOL049W 1476 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
ROT1Q03691 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms