Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YLR198CYLR198C 360 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 MRPS8YMR158W 468 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 TOM40YMR203W 1164 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YNL174WYNL174W 573 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YNL319WYNL319W 441 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 PFA4YOL003C 1137 nt4.94□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 TRM10YOL093W 882 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 snR10snR10 245 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 DXO1YDR370C 1329 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NEM1YHR004C 1341 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 HES1YOR237W 1305 nt4.94□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 FSH1YHR049W 732 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YIL086CYIL086C 309 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YKL169CYKL169C 384 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YLR169WYLR169W 354 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 TLG2YOL018C 1194 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 ZPS1YOL154W 750 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 ECM33YBR078W 1290 nt4.93□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 IMA1YGR287C 1770 nt4.93□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 ELP2YGR200C 2367 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 DIN7YDR263C 1293 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YGL101WYGL101W 648 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YGL185CYGL185C 1140 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 CKA2YOR061W 1020 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YOR292CYOR292C 930 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YPL199CYPL199C 723 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 RSC6YCR052W 1452 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 ROT2YBR229C 2865 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YJR124CYJR124C 1347 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NUP116YMR047C 3342 nt4.92□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YDR161WYDR161W 1164 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 CAB1YDR531W 1104 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YER138W-AYER138W-A 105 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 GRX4YER174C 735 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YGL262WYGL262W 528 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 OKP1YGR179C 1221 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 APS1YLR170C 471 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 SFT2YBL102W 648 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 ARG8YOL140W 1272 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 BAG7YOR134W 1230 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NHP6AYPR052C 282 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 IML2YJL082W 2196 nt4.91□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YMR102CYMR102C 2505 nt4.9□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 SET4YJL105W 1683 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 DBF4YDR052C 2115 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 UBA2YDR390C 1911 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 RTG3YBL103C 1461 nt4.9□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 AIR2YDL175C 1035 nt4.9□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR417CYDR417C 372 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YER134CYER134C 537 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 DUO1YGL061C 744 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 TRX2YGR209C 315 nt4.9□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YTA12YMR089C 2478 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GLT1YDL171C 6438 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ATM1YMR301C 2073 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YDL027CYDL027C 1263 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YDL158CYDL158C 309 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MRP13YGR084C 1020 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 DBP8YHR169W 1296 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MRPL39YML009C 213 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ERV41YML067C 1059 nt4.89□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 GTR1YML121W 933 nt4.89□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPL191CYPL191C 1083 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SLX1YBR228W 915 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 FAP1YNL023C 2898 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MEC3YLR288C 1425 nt4.89□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YOR1YGR281W 4434 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ERV14YGL054C 417 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ADH4YGL256W 1149 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YLF2YHL014C 1218 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YJR085CYJR085C 318 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 TRS33YOR115C 807 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 LAS21YJL062W 2493 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GDB1YPR184W 4611 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GMC1YDR506C 1827 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 UGA1YGR019W 1416 nt4.88□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 OCA5YHL029C 2040 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SED4YCR067C 3198 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SAY1YGR263C 1275 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 MDY2YOL111C 639 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 IRC14YOR135C 342 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GPI2YPL076W 843 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YDC1YPL087W 954 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 QCR2YPR191W 1107 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ASA1YPR085C 1332 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ARN2YHL047C 1863 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 KCH1YJR054W 1494 nt4.87□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 SIP5YMR140W 1470 nt4.87□□□□□ -1.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 BUD7YOR299W 2241 nt4.87□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 RIM15YFL033C 5313 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 PDR10YOR328W 4695 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GRS1YBR121C 2004 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 YPR1YDR368W 939 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 ERG26YGL001C 1050 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 GAT3YLR013W 426 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SEC39YLR440C 2130 nt4.86□□□□□ -1.63
PUF2Q12221 SPS18YNL204C 903 nt4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.2 ms