Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD1P11586 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD1P11586 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms