Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRNDQ9UKY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms