Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Alpk3Q924C5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Alpk3Q924C5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Alpk3Q924C5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Alpk3Q924C5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Alpk3Q924C5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms