Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN3O00409 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN3O00409 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN3O00409 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms