Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms