Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACSIN1Q9BY11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms