Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP69A5D8W1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP69A5D8W1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms