Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED17Q9NVC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED17Q9NVC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED17Q9NVC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms