Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECTIN1Q15223 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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