Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YEL077CYEL077C 3834 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SIT1YEL065W 1887 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 TRP5YGL026C 2124 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MST1YKL194C 1389 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 BRF1YGR246C 1791 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 GCS1YDL226C 1059 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YGR066CYGR066C 879 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 NCE103YNL036W 666 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YGP1YNL160W 1065 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YPL014WYPL014W 1146 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MRI1YPR118W 1236 nt5.81□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ALT1YLR089C 1779 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SRP101YDR292C 1866 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 QDR1YIL120W 1692 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YDL119CYDL119C 924 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 PCL9YDL179W 915 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ADD66YKL206C 804 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ERI1YPL096C-A 207 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 QRI1YDL103C 1434 nt5.8□□□□□ -1.48
VFA1P40080 DHH1YDL160C 1521 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MED2YDL005C 1296 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MPC1YGL080W 393 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SPG4YMR107W 348 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 URE2YNL229C 1065 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ARR1YPR199C 885 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SEC18YBR080C 2277 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 LSG1YGL099W 1923 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SRV2YNL138W 1581 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SIA1YOR137C 1869 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 DFG5YMR238W 1377 nt5.79□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YFL034WYFL034W 3222 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 FET3YMR058W 1911 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ABZ1YNR033W 2364 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 CBP4YGR174C 513 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ERP2YAL007C 648 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MTW1YAL034W-A 870 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 REX3YLR107W 1215 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 LEM3YNL323W 1245 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 ROX3YBL093C 663 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 TAH18YPR048W 1872 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 HSP104YLL026W 2727 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MNN2YBR015C 1794 nt5.78□□□□□ -1.48
VFA1P40080 EGD2YHR193C 525 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YKR073CYKR073C 321 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 TFS1YLR178C 660 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 RDL2YOR286W 450 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 VHS1YDR247W 1386 nt5.77□□□□□ -1.49
VFA1P40080 DAL4YIR028W 1908 nt5.76□□□□□ -1.49
VFA1P40080 SKI8YGL213C 1194 nt5.76□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YLL017WYLL017W 312 nt5.76□□□□□ -1.49
VFA1P40080 DOM34YNL001W 1161 nt5.76□□□□□ -1.49
VFA1P40080 RPS19BYNL302C 435 nt5.76□□□□□ -1.49
VFA1P40080 RPT2YDL007W 1314 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 DBP9YLR276C 1785 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 DAK1YML070W 1755 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 LSM6YDR378C 261 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YGR176WYGR176W 348 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 SCW4YGR279C 1161 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 OSW5YMR148W 447 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 GPM3YOL056W 912 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 CHL4YDR254W 1377 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 ULA1YPL003W 1389 nt5.75□□□□□ -1.49
VFA1P40080 GIR2YDR152W 798 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 IPI1YHR085W 1005 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 LSM12YHR121W 564 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 DAL82YNL314W 768 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 STE50YCL032W 1041 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 TOS4YLR183C 1470 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 ASF2YDL197C 1578 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 KIP2YPL155C 2121 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 URA7YBL039C 1740 nt5.74□□□□□ -1.49
VFA1P40080 MSS1YMR023C 1581 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 RTT106YNL206C 1368 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 snR78snR78 87 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 SSY5YJL156C 2100 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 MRPL4YLR439W 960 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 MFA2YNL145W 117 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 SCO1YBR037C 888 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 POS5YPL188W 1245 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 NUD1YOR373W 2556 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 CDC19YAL038W 1503 nt5.73□□□□□ -1.49
VFA1P40080 NFI1YOR156C 2181 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 HST4YDR191W 1113 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 RPR2YIR015W 435 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YOR024WYOR024W 324 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 YOR200WYOR200W 399 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 VMA13YPR036W 1437 nt5.72□□□□□ -1.49
VFA1P40080 NOP13YNL175C 1212 nt5.71□□□□□ -1.5
VFA1P40080 NRD1YNL251C 1728 nt5.71□□□□□ -1.5
VFA1P40080 LAP2YNL045W 2016 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YMR155WYMR155W 1644 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 MKC7YDR144C 1791 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YGL072CYGL072C 360 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YHR095WYHR095W 495 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YLR296WYLR296W 327 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YLR402WYLR402W 192 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 OAZ1YPL052W 879 nt5.7□□□□□ -1.5
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