Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	RPL21B	YPL079W	483 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	TOM5	YPR133W-A	153 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	DCC1	YCL016C	1143 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	SYG1	YIL047C	2709 nt		5.22	□□□□□ -1.57
ATG12	P38316	VPS29	YHR012W	849 nt		5.21	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	MIM2	YLR099W-A	264 nt		5.21	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YBR016W	YBR016W	387 nt		5.21	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.21	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	MLF3	YNL074C	1359 nt		5.2	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.2	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	SRP101	YDR292C	1866 nt		5.2	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	PAD1	YDR538W	729 nt		5.19	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.19	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	XPT1	YJR133W	630 nt		5.19	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	DRS1	YLL008W	2259 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	MNN10	YDR245W	1182 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	RML2	YEL050C	1182 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	GAT3	YLR013W	426 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	ISU2	YOR226C	471 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	HES1	YOR237W	1305 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.18	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YIL077C	YIL077C	963 nt		5.17	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	APN1	YKL114C	1104 nt		5.17	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	PEX22	YAL055W	543 nt		5.17	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.17	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	SEC18	YBR080C	2277 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	ATG7	YHR171W	1893 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YEL020C	YEL020C	1683 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	ERD1	YDR414C	1089 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		5.16	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	ENP1	YBR247C	1452 nt		5.15	□□□□□ -1.58
ATG12	P38316	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	ORM1	YGR038W	669 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	PUS6	YGR169C	1215 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	VPS72	YDR485C	2388 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	CHL4	YDR254W	1377 nt		5.15	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	ASN1	YPR145W	1719 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	NOP8	YOL144W	1455 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	RHO4	YKR055W	876 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	YNL165W	YNL165W	1221 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	AVO1	YOL078W	3531 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.14	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	ARB1	YER036C	1833 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	DRN1	YGR093W	1524 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	NAG1	YGR031C-A	492 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	CAB4	YGR277C	918 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	BGL2	YGR282C	942 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	CTR3	YLR411W	726 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	snR10	snR10	245 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	RPO26	YPR187W	468 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	UBX2	YML013W	1755 nt		5.13	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	PRR1	YKL116C	1557 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	KTI12	YKL110C	942 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	RDL2	YOR286W	450 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	YOR342C	YOR342C	960 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	OXP1	YKL215C	3861 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	LAS21	YJL062W	2493 nt		5.12	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		5.11	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	FEX1	YOR390W	1128 nt		5.11	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	FEX2	YPL279C	1128 nt		5.11	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	JEM1	YJL073W	1938 nt		5.11	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	SCM3	YDL139C	672 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	SIT1	YEL065W	1887 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	SEH1	YGL100W	1050 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	NCS6	YGL211W	1080 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	NUP116	YMR047C	3342 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.1	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	DDC1	YPL194W	1839 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	IMA2	YOL157C	1770 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	SER33	YIL074C	1410 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	NSG1	YHR133C	876 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	LDB19	YOR322C	2457 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	VPS1	YKR001C	2115 nt		5.09	□□□□□ -1.59
ATG12	P38316	ADE4	YMR300C	1533 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	IWR1	YDL115C	1062 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YGL072C	YGL072C	360 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YJL171C	YJL171C	1191 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.08	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	MCH4	YOL119C	1506 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	SPL2	YHR136C	447 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	FUN19	YAL034C	1242 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	RCL1	YOL010W	1104 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	SED4	YCR067C	3198 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	BRE2	YLR015W	1518 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.07	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	ZUO1	YGR285C	1302 nt		5.06	□□□□□ -1.6

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