Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX1Q9NSU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX1Q9NSU2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms