Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 MID1YNL291C 1647 nt5.48□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 ATP1YBL099W 1638 nt5.48□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 CLB1YGR108W 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 TAH18YPR048W 1872 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 ATG32YIL146C 1590 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 AAP1YHR047C 2571 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 YDL057WYDL057W 987 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 RPL12AYEL054C 498 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 PDE1YGL248W 1110 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 SKI6YGR195W 741 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 GTR1YML121W 933 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 DSE3YOR264W 1293 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 CWC27YPL064C 906 nt5.47□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 HIR1YBL008W 2523 nt5.46□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 VPS70YJR126C 2436 nt5.46□□□□□ -1.53
NMD4Q12129 GPA2YER020W 1350 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 IDP1YDL066W 1287 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SNZ3YFL059W 897 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SHP1YBL058W 1272 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SNZ2YNL333W 897 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PUF3YLL013C 2640 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MPP10YJR002W 1782 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 ORC5YNL261W 1440 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 NUD1YOR373W 2556 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PPR1YLR014C 2715 nt5.46□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PYC1YGL062W 3537 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PMA1YGL008C 2757 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 HSP104YLL026W 2727 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SMF2YHR050W 1650 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 ATO3YDR384C 828 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YJL171CYJL171C 1191 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 NOP13YNL175C 1212 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YOL131WYOL131W 327 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 CSG2YBR036C 1233 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YPR109WYPR109W 885 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MLC2YPR188C 492 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 GUA1YMR217W 1578 nt5.45□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SFB3YHR098C 2790 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YCL065WYCL065W 369 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MDH3YDL078C 1032 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SNM1YDR478W 597 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 VAM7YGL212W 951 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SKI8YGL213C 1194 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 IPI1YHR085W 1005 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YKR075CYKR075C 924 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YPL102CYPL102C 303 nt5.44□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 STE13YOR219C 2796 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YRA1YDR381W 681 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 IRC7YFR055W 1023 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SEN34YAR008W 828 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YBL029WYBL029W 1131 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 GFD1YMR255W 567 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YBL081WYBL081W 1107 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MCM6YGL201C 3054 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 HOF1YMR032W 2010 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 DXO1YDR370C 1329 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MKK2YPL140C 1521 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 FAT3YKL187C 2253 nt5.43□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 VHS1YDR247W 1386 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PRP46YPL151C 1356 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 CLA4YNL298W 2529 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 TNA1YGR260W 1605 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 RSM10YDR041W 612 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 CHO1YER026C 831 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 FMP48YGR052W 1110 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PAN6YIL145C 930 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MAD2YJL030W 591 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MRPL4YLR439W 960 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 TEL2YGR099W 2067 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 GIP1YBR045C 1920 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 MAD3YJL013C 1548 nt5.42□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 GCR2YNL199C 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YDL121CYDL121C 450 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YEL028WYEL028W 462 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SNO4YMR322C 714 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 NAT5YOR253W 531 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 HSP33YOR391C 714 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YPL113CYPL113C 1191 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 HSP32YPL280W 714 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PCL10YGL134W 1302 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 EPS1YIL005W 2106 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 HER2YMR293C 1395 nt5.41□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 ERG7YHR072W 2196 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 TUL1YKL034W 2277 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 DHH1YDL160C 1521 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 CTS2YDR371W 1536 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 ARP10YDR106W 855 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 YLR317WYLR317W 435 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 PFA3YNL326C 1011 nt5.4□□□□□ -1.54
NMD4Q12129 SDA1YGR245C 2304 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 YGR011WYGR011W 327 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 YJL107CYJL107C 1164 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 HCR1YLR192C 798 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 QDR3YBR043C 2070 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 HSF1YGL073W 2502 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 VMA13YPR036W 1437 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 GSH2YOL049W 1476 nt5.39□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 PIC2YER053C 903 nt5.38□□□□□ -1.55
NMD4Q12129 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.38□□□□□ -1.55
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