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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
BSC4
YNL269W
396 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YNR042W
YNR042W
429 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
RKI1
YOR095C
777 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
PEX27
YOR193W
1131 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YPL014W
YPL014W
1146 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YPR114W
YPR114W
948 nt
6
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
NFI1
YOR156C
2181 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
WHI2
YOR043W
1461 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YPR1
YDR368W
939 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
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YAL056C-A
351 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
MRPL13
YKR006C
795 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
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YLR198C
360 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
HAP3
YBL021C
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5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
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YML083C
1257 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
MTF1
YMR228W
1026 nt
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□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
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YNL019C
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5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YNL033W
YNL033W
855 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YFR006W
YFR006W
1608 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
DUG1
YFR044C
1446 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
UPS3
YDR185C
540 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
SKI8
YGL213C
1194 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
tR(ACG)J
tR(ACG)J
73 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
KRE9
YJL174W
831 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YLR169W
YLR169W
354 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
CTR3
YLR411W
726 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YOL038C-A
YOL038C-A
96 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YOL050C
YOL050C
321 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
MRP51
YPL118W
1035 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
HRQ1
YDR291W
3234 nt
5.98
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
VHS1
YDR247W
1386 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YTP1
YNL237W
1380 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
PHB1
YGR132C
864 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YIL086C
YIL086C
309 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
PAN6
YIL145C
930 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
MSN2
YMR037C
2115 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
YMR075C-A
YMR075C-A
366 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
RPC19
YNL113W
429 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
IES2
YNL215W
963 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
TFB4
YPR056W
1017 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
ECM7
YLR443W
1347 nt
5.97
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
MCM6
YGL201C
3054 nt
5.96
□□□□□ -1.45
SGO1
Q08490
ALD6
YPL061W
1503 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YDL158C
YDL158C
309 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YFR034W-A
YFR034W-A
288 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
FSH1
YHR049W
732 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
QCR8
YJL166W
285 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
GEP5
YLR091W
882 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
PCL1
YNL289W
840 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YPL062W
YPL062W
405 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
GUF1
YLR289W
1938 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YDR278C
YDR278C
318 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
PSR1
YLL010C
1284 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
MRPL4
YLR439W
960 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YMR010W
YMR010W
1218 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YOR020W-A
YOR020W-A
273 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
SCP1
YOR367W
603 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YPR123C
YPR123C
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5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YBR144C
YBR144C
315 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
VPS4
YPR173C
1314 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
KEX2
YNL238W
2445 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
GPB2
YAL056W
2643 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
BNA5
YLR231C
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5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
PYC2
YBR218C
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5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
TRP4
YDR354W
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5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YDR541C
YDR541C
1035 nt
5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
RHO4
YKR055W
876 nt
5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
ATG7
YHR171W
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5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
VPS70
YJR126C
2436 nt
5.94
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
ERV14
YGL054C
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5.93
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YGL101W
YGL101W
648 nt
5.93
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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YHL045W
348 nt
5.93
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
RRP4
YHR069C
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5.93
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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YIR042C
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5.93
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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YMR158W
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SGO1
Q08490
SLX1
YBR228W
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SGO1
Q08490
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YDR161W
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Q08490
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YGR011W
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□□□□□ -1.46
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Q08490
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YOL003C
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SGO1
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Q08490
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5.92
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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SGO1
Q08490
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YDR154C
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SGO1
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YGL194C-A
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□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
NCS6
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SGO1
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Q08490
BAG7
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□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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YNL223W
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5.9
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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5.9
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YJR015W
YJR015W
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5.9
□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.46
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YIL101C
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□□□□□ -1.46
SGO1
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YCR075W-A
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□□□□□ -1.46
SGO1
Q08490
YER138W-A
YER138W-A
105 nt
5.9
□□□□□ -1.46
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