Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 SCO1YBR037C 888 nt7.38□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 SLX5YDL013W 1860 nt7.38□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 SMF3YLR034C 1422 nt7.38□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 CAB1YDR531W 1104 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 PFA3YNL326C 1011 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YEH2YLR020C 1617 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 ACS2YLR153C 2052 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 PRM1YNL279W 1986 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YHR214WYHR214W 612 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YAR066WYAR066W 612 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 PGA2YNL149C 390 nt7.37□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 RIO1YOR119C 1455 nt7.36□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 KIP2YPL155C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 PRR1YKL116C 1557 nt7.36□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YNL057WYNL057W 333 nt7.36□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YAP1802YGR241C 1707 nt7.35□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 DBR1YKL149C 1218 nt7.35□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 SPS19YNL202W 879 nt7.34□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YNL217WYNL217W 981 nt7.34□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 ATG14YBR128C 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 NTH2YBR001C 2343 nt7.34□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YMR027WYMR027W 1413 nt7.34□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 YEF1YEL041W 1488 nt7.34□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 MRF1YGL143C 1242 nt7.33□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 SIP2YGL208W 1248 nt7.33□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YNK1YKL067W 462 nt7.33□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 SNT2YGL131C 4212 nt7.33□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 LPL1YOR059C 1353 nt7.33□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 MRM2YGL136C 963 nt7.32□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 CHO1YER026C 831 nt7.32□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YNL134CYNL134C 1131 nt7.32□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 MTC5YDR128W 3447 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 NOG2YNR053C 1461 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YFL034WYFL034W 3222 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YDR133CYDR133C 336 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 NSG1YHR133C 876 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 APS1YLR170C 471 nt7.31□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 DOA1YKL213C 2148 nt7.3□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YBL010CYBL010C 843 nt7.3□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 RGD1YBR260C 2001 nt7.3□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 ECM3YOR092W 1842 nt7.3□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 ERD1YDR414C 1089 nt7.29□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 NAG1YGR031C-A 492 nt7.29□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 YKE4YIL023C 1041 nt7.29□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 ATE1YGL017W 1512 nt7.28□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 TYS1YGR185C 1185 nt7.28□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 RHO2YNL090W 579 nt7.28□□□□□ -1.24
GDB1Q06625 BNA6YFR047C 888 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 LEM3YNL323W 1245 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 HAS1YMR290C 1518 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 KTI12YKL110C 942 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 RHO4YKR055W 876 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 MDG1YNL173C 1101 nt7.27□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 STF1YDL130W-A 261 nt7.26□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 NQM1YGR043C 1002 nt7.26□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 HRR25YPL204W 1485 nt7.26□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 CLB2YPR119W 1476 nt7.26□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 GLO2YDR272W 825 nt7.25□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 CDC43YGL155W 1131 nt7.25□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 SCW10YMR305C 1170 nt7.25□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 BUD7YOR299W 2241 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 SIF2YBR103W 1608 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 NIT2YJL126W 924 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 ACP1YKL192C 378 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YML101C-AYML101C-A 318 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 MAP2YBL091C 1266 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YOR024WYOR024W 324 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 SAC6YDR129C 1929 nt7.24□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 FUI1YBL042C 1920 nt7.23□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 HMS2YJR147W 1077 nt7.23□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 NSE5YML023C 1671 nt7.23□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 SPL2YHR136C 447 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YAR023CYAR023C 540 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YIF1YNL263C 945 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 FOL1YNL256W 2475 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 THP1YOL072W 1368 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 YPL191CYPL191C 1083 nt7.22□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 CSC1YLR241W 2349 nt7.21□□□□□ -1.25
GDB1Q06625 SNU71YGR013W 1863 nt7.21□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 NOP16YER002W 696 nt7.21□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 YHR140WYHR140W 720 nt7.21□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 HXT5YHR096C 1779 nt7.21□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 EXO70YJL085W 1872 nt7.2□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.2□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 TRM10YOL093W 882 nt7.2□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 UGA2YBR006W 1494 nt7.2□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 ESC8YOL017W 2145 nt7.19□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 PDI1YCL043C 1569 nt7.19□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 BRF1YGR246C 1791 nt7.18□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 KTR5YNL029C 1569 nt7.18□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 AMA1YGR225W 1782 nt7.18□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 MMT2YPL224C 1455 nt7.18□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 HXT15YDL245C 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 HXT16YJR158W 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 RGS2YOR107W 930 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 PTK2YJR059W 2457 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 RAT1YOR048C 3021 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 HXT4YHR092C 1731 nt7.17□□□□□ -1.26
GDB1Q06625 FUN19YAL034C 1242 nt7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms