Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HIPK3Q9H422 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK3Q9H422 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK3Q9H422 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms