Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk38lQ7TSE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk38lQ7TSE6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stk38lQ7TSE6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms