Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SNF11YDR073W 510 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 APS3YJL024C 585 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YML083CYML083C 1257 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YOL079WYOL079W 399 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 PYC1YGL062W 3537 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 BZZ1YHR114W 1902 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 HOS1YPR068C 1413 nt6.5□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 CCZ1YBR131W 2115 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RAI1YGL246C 1164 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 MRP17YKL003C 396 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RSA3YLR221C 663 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 DIA3YDL024C 1407 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 ECM7YLR443W 1347 nt6.49□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 UTP9YHR196W 1728 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YGL036WYGL036W 2730 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RPS2YGL123W 765 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RHO4YKR055W 876 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 COX17YLL009C 210 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 VBA1YMR088C 1689 nt6.48□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 VNX1YNL321W 2727 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YEA6YEL006W 1008 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 MPM1YJL066C 759 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 HSP150YJL159W 1242 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YKL031WYKL031W 414 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 ICT1YLR099C 1185 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 YNL234WYNL234W 1281 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 RDL1YOR285W 420 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 CSG2YBR036C 1233 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 MRI1YPR118W 1236 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 SHM1YBR263W 1473 nt6.47□□□□□ -1.37
CLF1Q12309 PKC1YBL105C 3456 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 RMD9YGL107C 1941 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 PRP40YKL012W 1752 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YMR155WYMR155W 1644 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 HSP78YDR258C 2436 nt6.46□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 KEL1YHR158C 3495 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 SKI2YLR398C 3864 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 COX9YDL067C 180 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 GIR2YDR152W 798 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 KSS1YGR040W 1107 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 RME1YGR044C 903 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YDR514CYDR514C 1452 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 PRP24YMR268C 1335 nt6.45□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YDR154CYDR154C 351 nt6.44□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YDR396WYDR396W 501 nt6.44□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ADK2YER170W 678 nt6.44□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 EFM3YJR129C 1020 nt6.44□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 PRP46YPL151C 1356 nt6.44□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 NUD1YOR373W 2556 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 EAF5YEL018W 840 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YGR176WYGR176W 348 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 HCR1YLR192C 798 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YNL108CYNL108C 813 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ARR3YPR201W 1215 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 RCK1YGL158W 1539 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YBR138CYBR138C 1575 nt6.43□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ERC1YHR032W 1746 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 SUA5YGL169W 1281 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 STM1YLR150W 822 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YML131WYML131W 1098 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YMR114CYMR114C 1107 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 LST8YNL006W 912 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ORC5YNL261W 1440 nt6.42□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 VPS1YKR001C 2115 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ESC8YOL017W 2145 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ADY2YCR010C 852 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 SEC20YDR498C 1152 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 MPC1YGL080W 393 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 Q0144Q0144 330 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 RHO3YIL118W 696 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YKR073CYKR073C 321 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 PEX12YMR026C 1200 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YNL194CYNL194C 906 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ELA1YNL230C 1140 nt6.41□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 MRC1YCL061C 3291 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 YML082WYML082W 1950 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 ISY1YJR050W 708 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 DCN1YLR128W 810 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 VMA4YOR332W 702 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 HAL1YPR005C 885 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 PDB1YBR221C 1101 nt6.4□□□□□ -1.38
CLF1Q12309 VPS4YPR173C 1314 nt6.4□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ECM3YOR092W 1842 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 VAM7YGL212W 951 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 EFM4YIL064W 774 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 YJR115WYJR115W 510 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 APN1YKL114C 1104 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 OAC1YKL120W 975 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 DOM34YNL001W 1161 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ARG1YOL058W 1263 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ODC2YOR222W 924 nt6.39□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ARP2YDL029W 1176 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 ATO3YDR384C 828 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 TAL1YLR354C 1008 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 PIN2YOR104W 849 nt6.38□□□□□ -1.39
CLF1Q12309 RBA50YDR527W 1320 nt6.38□□□□□ -1.39
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