Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Schip1P0DPB4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Schip1P0DPB4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms