Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AireQ9Z0E3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AireQ9Z0E3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AireQ9Z0E3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AireQ9Z0E3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AireQ9Z0E3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AireQ9Z0E3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AireQ9Z0E3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AireQ9Z0E3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AireQ9Z0E3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AireQ9Z0E3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AireQ9Z0E3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AireQ9Z0E3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AireQ9Z0E3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AireQ9Z0E3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AireQ9Z0E3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AireQ9Z0E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AireQ9Z0E3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AireQ9Z0E3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AireQ9Z0E3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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