Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
AireQ9Z0E3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AireQ9Z0E3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AireQ9Z0E3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AireQ9Z0E3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AireQ9Z0E3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AireQ9Z0E3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AireQ9Z0E3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AireQ9Z0E3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AireQ9Z0E3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
AireQ9Z0E3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AireQ9Z0E3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AireQ9Z0E3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AireQ9Z0E3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AireQ9Z0E3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AireQ9Z0E3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AireQ9Z0E3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AireQ9Z0E3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AireQ9Z0E3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AireQ9Z0E3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AireQ9Z0E3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AireQ9Z0E3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AireQ9Z0E3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AireQ9Z0E3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AireQ9Z0E3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AireQ9Z0E3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AireQ9Z0E3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AireQ9Z0E3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AireQ9Z0E3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AireQ9Z0E3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AireQ9Z0E3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AireQ9Z0E3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AireQ9Z0E3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AireQ9Z0E3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AireQ9Z0E3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AireQ9Z0E3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AireQ9Z0E3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AireQ9Z0E3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AireQ9Z0E3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AireQ9Z0E3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AireQ9Z0E3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AireQ9Z0E3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AireQ9Z0E3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AireQ9Z0E3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AireQ9Z0E3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AireQ9Z0E3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AireQ9Z0E3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AireQ9Z0E3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AireQ9Z0E3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AireQ9Z0E3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AireQ9Z0E3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AireQ9Z0E3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AireQ9Z0E3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AireQ9Z0E3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AireQ9Z0E3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AireQ9Z0E3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AireQ9Z0E3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AireQ9Z0E3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AireQ9Z0E3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AireQ9Z0E3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AireQ9Z0E3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AireQ9Z0E3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AireQ9Z0E3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AireQ9Z0E3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AireQ9Z0E3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AireQ9Z0E3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AireQ9Z0E3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AireQ9Z0E3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AireQ9Z0E3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AireQ9Z0E3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AireQ9Z0E3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AireQ9Z0E3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AireQ9Z0E3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AireQ9Z0E3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AireQ9Z0E3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AireQ9Z0E3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AireQ9Z0E3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AireQ9Z0E3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AireQ9Z0E3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AireQ9Z0E3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AireQ9Z0E3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AireQ9Z0E3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AireQ9Z0E3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AireQ9Z0E3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AireQ9Z0E3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AireQ9Z0E3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AireQ9Z0E3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AireQ9Z0E3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AireQ9Z0E3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AireQ9Z0E3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AireQ9Z0E3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AireQ9Z0E3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AireQ9Z0E3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AireQ9Z0E3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AireQ9Z0E3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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