Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nphs1Q9QZS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nphs1Q9QZS7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphs1Q9QZS7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphs1Q9QZS7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphs1Q9QZS7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nphs1Q9QZS7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphs1Q9QZS7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphs1Q9QZS7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphs1Q9QZS7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphs1Q9QZS7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphs1Q9QZS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphs1Q9QZS7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms