Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Slco6d1Q9D5W6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slco6d1Q9D5W6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slco6d1Q9D5W6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slco6d1Q9D5W6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slco6d1Q9D5W6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slco6d1Q9D5W6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slco6d1Q9D5W6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slco6d1Q9D5W6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slco6d1Q9D5W6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slco6d1Q9D5W6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slco6d1Q9D5W6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slco6d1Q9D5W6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slco6d1Q9D5W6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slco6d1Q9D5W6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slco6d1Q9D5W6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slco6d1Q9D5W6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slco6d1Q9D5W6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slco6d1Q9D5W6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slco6d1Q9D5W6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slco6d1Q9D5W6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slco6d1Q9D5W6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slco6d1Q9D5W6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slco6d1Q9D5W6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slco6d1Q9D5W6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slco6d1Q9D5W6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slco6d1Q9D5W6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slco6d1Q9D5W6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slco6d1Q9D5W6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slco6d1Q9D5W6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slco6d1Q9D5W6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slco6d1Q9D5W6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slco6d1Q9D5W6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slco6d1Q9D5W6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slco6d1Q9D5W6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slco6d1Q9D5W6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slco6d1Q9D5W6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slco6d1Q9D5W6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slco6d1Q9D5W6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slco6d1Q9D5W6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Slco6d1Q9D5W6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slco6d1Q9D5W6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slco6d1Q9D5W6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slco6d1Q9D5W6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slco6d1Q9D5W6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slco6d1Q9D5W6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slco6d1Q9D5W6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slco6d1Q9D5W6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slco6d1Q9D5W6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slco6d1Q9D5W6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slco6d1Q9D5W6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slco6d1Q9D5W6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slco6d1Q9D5W6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slco6d1Q9D5W6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slco6d1Q9D5W6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slco6d1Q9D5W6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slco6d1Q9D5W6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slco6d1Q9D5W6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slco6d1Q9D5W6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slco6d1Q9D5W6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms