Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arl13aQ9D416 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arl13aQ9D416 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arl13aQ9D416 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arl13aQ9D416 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arl13aQ9D416 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arl13aQ9D416 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Arl13aQ9D416 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl13aQ9D416 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arl13aQ9D416 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arl13aQ9D416 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arl13aQ9D416 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arl13aQ9D416 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arl13aQ9D416 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Arl13aQ9D416 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl13aQ9D416 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl13aQ9D416 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arl13aQ9D416 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arl13aQ9D416 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13aQ9D416 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl13aQ9D416 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arl13aQ9D416 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arl13aQ9D416 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arl13aQ9D416 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl13aQ9D416 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arl13aQ9D416 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arl13aQ9D416 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arl13aQ9D416 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arl13aQ9D416 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arl13aQ9D416 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl13aQ9D416 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arl13aQ9D416 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl13aQ9D416 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arl13aQ9D416 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl13aQ9D416 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl13aQ9D416 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arl13aQ9D416 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arl13aQ9D416 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl13aQ9D416 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl13aQ9D416 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl13aQ9D416 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl13aQ9D416 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl13aQ9D416 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl13aQ9D416 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arl13aQ9D416 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl13aQ9D416 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl13aQ9D416 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl13aQ9D416 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl13aQ9D416 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arl13aQ9D416 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl13aQ9D416 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arl13aQ9D416 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arl13aQ9D416 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arl13aQ9D416 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms