Protein–RNA interactions for Protein: Q99208

YLL066C, Y' element ATP-dependent helicase YLL066C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL066CQ99208 DSK2YMR276W 1122 nt16.29■□□□□ 0.2
YLL066CQ99208 YJL152WYJL152W 360 nt16.26■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.25■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.25■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt16.25■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 YCH1YGR203W 447 nt16.21■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 TIR4YOR009W 1464 nt16.21■□□□□ 0.19
YLL066CQ99208 LPX1YOR084W 1164 nt16.13■□□□□ 0.17
YLL066CQ99208 SIS1YNL007C 1059 nt16.12■□□□□ 0.17
YLL066CQ99208 SPT5YML010W 3192 nt16.08■□□□□ 0.16
YLL066CQ99208 PTP1YDL230W 1008 nt16.04■□□□□ 0.16
YLL066CQ99208 MEP2YNL142W 1500 nt16.03■□□□□ 0.16
YLL066CQ99208 ART5YGR068C 1761 nt16.02■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 RPP2AYOL039W 321 nt16.01■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 SPP1YPL138C 1062 nt16.01■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 IMP2'YIL154C 1041 nt15.99■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 DCW1YKL046C 1350 nt15.98■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 IDH1YNL037C 1083 nt15.96■□□□□ 0.15
YLL066CQ99208 MXR2YCL033C 507 nt15.94■□□□□ 0.14
YLL066CQ99208 GFD2YCL036W 1701 nt15.94■□□□□ 0.14
YLL066CQ99208 YDR433WYDR433W 441 nt15.92■□□□□ 0.14
YLL066CQ99208 YMR057CYMR057C 372 nt15.91■□□□□ 0.14
YLL066CQ99208 CAC2YML102W 1407 nt15.9■□□□□ 0.14
YLL066CQ99208 ERV46YAL042W 1248 nt15.89■□□□□ 0.13
YLL066CQ99208 RTS2YOR077W 699 nt15.87■□□□□ 0.13
YLL066CQ99208 GBP2YCL011C 1284 nt15.86■□□□□ 0.13
YLL066CQ99208 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.75■□□□□ 0.11
YLL066CQ99208 PET9YBL030C 957 nt15.75■□□□□ 0.11
YLL066CQ99208 YKR040CYKR040C 504 nt15.67■□□□□ 0.1
YLL066CQ99208 EMI2YDR516C 1503 nt15.66■□□□□ 0.1
YLL066CQ99208 FPS1YLL043W 2010 nt15.65■□□□□ 0.1
YLL066CQ99208 IRC15YPL017C 1500 nt15.64■□□□□ 0.1
YLL066CQ99208 RTG1YOL067C 534 nt15.64■□□□□ 0.09
YLL066CQ99208 DED1YOR204W 1815 nt15.61■□□□□ 0.09
YLL066CQ99208 TCD2YKL027W 1344 nt15.57■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 RRD1YIL153W 1182 nt15.57■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 YDL221WYDL221W 552 nt15.55■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.55■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 YEL076CYEL076C 651 nt15.55■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 YLR464WYLR464W 651 nt15.55■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 MRPL8YJL063C 717 nt15.53■□□□□ 0.08
YLL066CQ99208 GIS3YLR094C 1509 nt15.48■□□□□ 0.07
YLL066CQ99208 FRD1YEL047C 1413 nt15.48■□□□□ 0.07
YLL066CQ99208 PTH1YHR189W 573 nt15.46■□□□□ 0.07
YLL066CQ99208 CUE1YMR264W 612 nt15.46■□□□□ 0.07
YLL066CQ99208 FMT1YBL013W 1206 nt15.45■□□□□ 0.06
YLL066CQ99208 SSA4YER103W 1929 nt15.38■□□□□ 0.05
YLL066CQ99208 UBX6YJL048C 1191 nt15.37■□□□□ 0.05
YLL066CQ99208 ADO1YJR105W 1023 nt15.36■□□□□ 0.05
YLL066CQ99208 YMR090WYMR090W 684 nt15.3■□□□□ 0.04
YLL066CQ99208 SOR2YDL246C 1074 nt15.29■□□□□ 0.04
YLL066CQ99208 SOR1YJR159W 1074 nt15.29■□□□□ 0.04
YLL066CQ99208 SDH1YKL148C 1923 nt15.28■□□□□ 0.04
YLL066CQ99208 YCL042WYCL042W 360 nt15.27■□□□□ 0.04
YLL066CQ99208 SCC4YER147C 1875 nt15.25■□□□□ 0.03
YLL066CQ99208 CWP1YKL096W 720 nt15.24■□□□□ 0.03
YLL066CQ99208 YIL100WYIL100W 354 nt15.24■□□□□ 0.03
YLL066CQ99208 YBR220CYBR220C 1683 nt15.23■□□□□ 0.03
YLL066CQ99208 ADH2YMR303C 1047 nt15.21■□□□□ 0.02
YLL066CQ99208 HUA1YGR268C 597 nt15.17■□□□□ 0.02
YLL066CQ99208 LCB1YMR296C 1677 nt15.13■□□□□ 0.01
YLL066CQ99208 YKL030WYKL030W 606 nt15.09■□□□□ 0.01
YLL066CQ99208 FMP52YER004W 696 nt15.08■□□□□ 0
YLL066CQ99208 YLR235CYLR235C 399 nt15.07■□□□□ 0
YLL066CQ99208 DIC1YLR348C 897 nt15.01□□□□□ -0.01
YLL066CQ99208 PCM1YEL058W 1674 nt15□□□□□ -0.01
YLL066CQ99208 RRT12YCR045C 1476 nt15□□□□□ -0.01
YLL066CQ99208 YDR094WYDR094W 336 nt14.98□□□□□ -0.01
YLL066CQ99208 SNF6YHL025W 999 nt14.97□□□□□ -0.01
YLL066CQ99208 YSC84YHR016C 1407 nt14.93□□□□□ -0.02
YLL066CQ99208 TIM23YNR017W 669 nt14.92□□□□□ -0.02
YLL066CQ99208 YLR179CYLR179C 606 nt14.85□□□□□ -0.03
YLL066CQ99208 YHL050CYHL050C 2094 nt14.85□□□□□ -0.03
YLL066CQ99208 YNL195CYNL195C 786 nt14.84□□□□□ -0.03
YLL066CQ99208 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.83□□□□□ -0.04
YLL066CQ99208 PRE6YOL038W 765 nt14.81□□□□□ -0.04
YLL066CQ99208 YIH1YCR059C 777 nt14.79□□□□□ -0.04
YLL066CQ99208 BIO4YNR057C 714 nt14.77□□□□□ -0.04
YLL066CQ99208 RNQ1YCL028W 1218 nt14.76□□□□□ -0.05
YLL066CQ99208 WSC2YNL283C 1512 nt14.76□□□□□ -0.05
YLL066CQ99208 PAU16YKL224C 372 nt14.74□□□□□ -0.05
YLL066CQ99208 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.73□□□□□ -0.05
YLL066CQ99208 YLL053CYLL053C 459 nt14.73□□□□□ -0.05
YLL066CQ99208 SIM1YIL123W 1431 nt14.69□□□□□ -0.06
YLL066CQ99208 BDF1YLR399C 2061 nt14.69□□□□□ -0.06
YLL066CQ99208 YPR064WYPR064W 420 nt14.64□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 FTR1YER145C 1215 nt14.6□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 YFR018CYFR018C 1092 nt14.6□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 AHT1YHR093W 549 nt14.6□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 TAD3YLR316C 969 nt14.59□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 GAL1YBR020W 1587 nt14.59□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 TRM5YHR070W 1500 nt14.58□□□□□ -0.07
YLL066CQ99208 YFL066CYFL066C 1179 nt14.55□□□□□ -0.08
YLL066CQ99208 TAT1YBR069C 1860 nt14.52□□□□□ -0.08
YLL066CQ99208 ATF2YGR177C 1608 nt14.51□□□□□ -0.09
YLL066CQ99208 SEC11YIR022W 504 nt14.46□□□□□ -0.1
YLL066CQ99208 SBA1YKL117W 651 nt14.46□□□□□ -0.1
YLL066CQ99208 BDH1YAL060W 1149 nt14.45□□□□□ -0.1
YLL066CQ99208 RRT5YFR032C 870 nt14.44□□□□□ -0.1
YLL066CQ99208 PEX25YPL112C 1185 nt14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms