Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx16Q8C080 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx16Q8C080 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx16Q8C080 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx16Q8C080 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx16Q8C080 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx16Q8C080 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx16Q8C080 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx16Q8C080 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx16Q8C080 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx16Q8C080 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx16Q8C080 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx16Q8C080 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx16Q8C080 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx16Q8C080 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx16Q8C080 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx16Q8C080 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx16Q8C080 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx16Q8C080 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx16Q8C080 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx16Q8C080 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx16Q8C080 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx16Q8C080 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx16Q8C080 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx16Q8C080 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx16Q8C080 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx16Q8C080 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx16Q8C080 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx16Q8C080 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx16Q8C080 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Snx16Q8C080 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx16Q8C080 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx16Q8C080 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx16Q8C080 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx16Q8C080 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx16Q8C080 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx16Q8C080 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx16Q8C080 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx16Q8C080 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx16Q8C080 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx16Q8C080 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx16Q8C080 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx16Q8C080 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snx16Q8C080 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx16Q8C080 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx16Q8C080 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snx16Q8C080 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx16Q8C080 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx16Q8C080 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx16Q8C080 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx16Q8C080 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx16Q8C080 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx16Q8C080 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx16Q8C080 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx16Q8C080 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx16Q8C080 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx16Q8C080 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx16Q8C080 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx16Q8C080 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx16Q8C080 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx16Q8C080 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx16Q8C080 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx16Q8C080 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx16Q8C080 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx16Q8C080 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx16Q8C080 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx16Q8C080 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx16Q8C080 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms