Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Atf3Q60765 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Atf3Q60765 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Atf3Q60765 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Atf3Q60765 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Atf3Q60765 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Atf3Q60765 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Atf3Q60765 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Atf3Q60765 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Atf3Q60765 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Atf3Q60765 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Atf3Q60765 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Atf3Q60765 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Atf3Q60765 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Atf3Q60765 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Atf3Q60765 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Atf3Q60765 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Atf3Q60765 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Atf3Q60765 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Atf3Q60765 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Atf3Q60765 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Atf3Q60765 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Atf3Q60765 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Atf3Q60765 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Atf3Q60765 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Atf3Q60765 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Atf3Q60765 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Atf3Q60765 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atf3Q60765 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atf3Q60765 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Atf3Q60765 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Atf3Q60765 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atf3Q60765 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Atf3Q60765 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Atf3Q60765 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Atf3Q60765 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Atf3Q60765 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Atf3Q60765 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Atf3Q60765 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Atf3Q60765 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Atf3Q60765 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Atf3Q60765 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Atf3Q60765 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Atf3Q60765 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Atf3Q60765 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Atf3Q60765 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Atf3Q60765 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Atf3Q60765 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Atf3Q60765 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Atf3Q60765 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Atf3Q60765 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Atf3Q60765 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Atf3Q60765 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Atf3Q60765 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Atf3Q60765 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Atf3Q60765 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Atf3Q60765 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Atf3Q60765 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atf3Q60765 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atf3Q60765 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atf3Q60765 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Atf3Q60765 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Atf3Q60765 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Atf3Q60765 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Atf3Q60765 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Atf3Q60765 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Atf3Q60765 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Atf3Q60765 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Atf3Q60765 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Atf3Q60765 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Atf3Q60765 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Atf3Q60765 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Atf3Q60765 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Atf3Q60765 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Atf3Q60765 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Atf3Q60765 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atf3Q60765 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atf3Q60765 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.8 ms