Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zfyve27Q3TXX3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfyve27Q3TXX3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zfyve27Q3TXX3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zfyve27Q3TXX3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfyve27Q3TXX3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfyve27Q3TXX3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfyve27Q3TXX3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfyve27Q3TXX3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfyve27Q3TXX3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfyve27Q3TXX3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfyve27Q3TXX3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfyve27Q3TXX3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfyve27Q3TXX3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfyve27Q3TXX3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfyve27Q3TXX3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfyve27Q3TXX3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zfyve27Q3TXX3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Zfyve27Q3TXX3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfyve27Q3TXX3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfyve27Q3TXX3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfyve27Q3TXX3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfyve27Q3TXX3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfyve27Q3TXX3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfyve27Q3TXX3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfyve27Q3TXX3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfyve27Q3TXX3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfyve27Q3TXX3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfyve27Q3TXX3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfyve27Q3TXX3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfyve27Q3TXX3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfyve27Q3TXX3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfyve27Q3TXX3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfyve27Q3TXX3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfyve27Q3TXX3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfyve27Q3TXX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfyve27Q3TXX3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfyve27Q3TXX3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfyve27Q3TXX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfyve27Q3TXX3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfyve27Q3TXX3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfyve27Q3TXX3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Zfyve27Q3TXX3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zfyve27Q3TXX3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfyve27Q3TXX3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfyve27Q3TXX3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfyve27Q3TXX3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfyve27Q3TXX3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfyve27Q3TXX3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zfyve27Q3TXX3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zfyve27Q3TXX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfyve27Q3TXX3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfyve27Q3TXX3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfyve27Q3TXX3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfyve27Q3TXX3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfyve27Q3TXX3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfyve27Q3TXX3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfyve27Q3TXX3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfyve27Q3TXX3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfyve27Q3TXX3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfyve27Q3TXX3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfyve27Q3TXX3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfyve27Q3TXX3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfyve27Q3TXX3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfyve27Q3TXX3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfyve27Q3TXX3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfyve27Q3TXX3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfyve27Q3TXX3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfyve27Q3TXX3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfyve27Q3TXX3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms