Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 DSK2YMR276W 1122 nt13.03□□□□□ -0.32
CTF3Q12748 SIS1YNL007C 1059 nt13.01□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 YJL152WYJL152W 360 nt13□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 MOT3YMR070W 1473 nt12.99□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 YLR236CYLR236C 324 nt12.99□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 FMP45YDL222C 930 nt12.97□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 IMP2'YIL154C 1041 nt12.97□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
CTF3Q12748 MEP2YNL142W 1500 nt12.9□□□□□ -0.34
CTF3Q12748 RPP2AYOL039W 321 nt12.9□□□□□ -0.34
CTF3Q12748 YCH1YGR203W 447 nt12.88□□□□□ -0.35
CTF3Q12748 TIR4YOR009W 1464 nt12.88□□□□□ -0.35
CTF3Q12748 PTP1YDL230W 1008 nt12.83□□□□□ -0.36
CTF3Q12748 IDH1YNL037C 1083 nt12.81□□□□□ -0.36
CTF3Q12748 ART5YGR068C 1761 nt12.81□□□□□ -0.36
CTF3Q12748 LPX1YOR084W 1164 nt12.77□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 DCW1YKL046C 1350 nt12.73□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 ERV46YAL042W 1248 nt12.73□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 PET9YBL030C 957 nt12.73□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 YMR057CYMR057C 372 nt12.73□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 GFD2YCL036W 1701 nt12.71□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 YDR433WYDR433W 441 nt12.71□□□□□ -0.37
CTF3Q12748 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.38
CTF3Q12748 GBP2YCL011C 1284 nt12.69□□□□□ -0.38
CTF3Q12748 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.64□□□□□ -0.39
CTF3Q12748 SPP1YPL138C 1062 nt12.63□□□□□ -0.39
CTF3Q12748 YKR040CYKR040C 504 nt12.62□□□□□ -0.39
CTF3Q12748 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
CTF3Q12748 EMI2YDR516C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
CTF3Q12748 RTS2YOR077W 699 nt12.56□□□□□ -0.4
CTF3Q12748 MRPL8YJL063C 717 nt12.52□□□□□ -0.41
CTF3Q12748 TCD2YKL027W 1344 nt12.51□□□□□ -0.41
CTF3Q12748 FPS1YLL043W 2010 nt12.5□□□□□ -0.41
CTF3Q12748 IRC15YPL017C 1500 nt12.49□□□□□ -0.41
CTF3Q12748 YDL221WYDL221W 552 nt12.49□□□□□ -0.41
CTF3Q12748 DED1YOR204W 1815 nt12.44□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 YMR090WYMR090W 684 nt12.44□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 RRD1YIL153W 1182 nt12.42□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 RTG1YOL067C 534 nt12.42□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.41□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 YEL076CYEL076C 651 nt12.41□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 YLR464WYLR464W 651 nt12.41□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 CUE1YMR264W 612 nt12.41□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 GIS3YLR094C 1509 nt12.41□□□□□ -0.42
CTF3Q12748 ADO1YJR105W 1023 nt12.39□□□□□ -0.43
CTF3Q12748 Q0182Q0182 405 nt12.37□□□□□ -0.43
CTF3Q12748 SSA4YER103W 1929 nt12.37□□□□□ -0.43
CTF3Q12748 FRD1YEL047C 1413 nt12.35□□□□□ -0.43
CTF3Q12748 FMT1YBL013W 1206 nt12.31□□□□□ -0.44
CTF3Q12748 SDH1YKL148C 1923 nt12.29□□□□□ -0.44
CTF3Q12748 SCC4YER147C 1875 nt12.27□□□□□ -0.44
CTF3Q12748 YCL042WYCL042W 360 nt12.27□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 YIL100WYIL100W 354 nt12.26□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 YBR220CYBR220C 1683 nt12.24□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 SOR2YDL246C 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 SOR1YJR159W 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 PTH1YHR189W 573 nt12.22□□□□□ -0.45
CTF3Q12748 HUA1YGR268C 597 nt12.19□□□□□ -0.46
CTF3Q12748 FMP52YER004W 696 nt12.18□□□□□ -0.46
CTF3Q12748 CWP1YKL096W 720 nt12.16□□□□□ -0.46
CTF3Q12748 UBX6YJL048C 1191 nt12.15□□□□□ -0.46
CTF3Q12748 YLR235CYLR235C 399 nt12.13□□□□□ -0.47
CTF3Q12748 ADH2YMR303C 1047 nt12.13□□□□□ -0.47
CTF3Q12748 YKL030WYKL030W 606 nt12.11□□□□□ -0.47
CTF3Q12748 LCB1YMR296C 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
CTF3Q12748 PCM1YEL058W 1674 nt12.04□□□□□ -0.48
CTF3Q12748 YNL195CYNL195C 786 nt12.02□□□□□ -0.49
CTF3Q12748 SNF6YHL025W 999 nt12□□□□□ -0.49
CTF3Q12748 RRT12YCR045C 1476 nt11.99□□□□□ -0.49
CTF3Q12748 YDR094WYDR094W 336 nt11.98□□□□□ -0.49
CTF3Q12748 DIC1YLR348C 897 nt11.97□□□□□ -0.49
CTF3Q12748 TIM23YNR017W 669 nt11.94□□□□□ -0.5
CTF3Q12748 YSC84YHR016C 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
CTF3Q12748 YHL050CYHL050C 2094 nt11.9□□□□□ -0.51
CTF3Q12748 RNQ1YCL028W 1218 nt11.89□□□□□ -0.51
CTF3Q12748 YIH1YCR059C 777 nt11.88□□□□□ -0.51
CTF3Q12748 YLR179CYLR179C 606 nt11.88□□□□□ -0.51
CTF3Q12748 BDF1YLR399C 2061 nt11.85□□□□□ -0.51
CTF3Q12748 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.8□□□□□ -0.52
CTF3Q12748 YPR064WYPR064W 420 nt11.8□□□□□ -0.52
CTF3Q12748 SIM1YIL123W 1431 nt11.79□□□□□ -0.52
CTF3Q12748 BIO4YNR057C 714 nt11.79□□□□□ -0.52
CTF3Q12748 YLL053CYLL053C 459 nt11.78□□□□□ -0.52
CTF3Q12748 WSC2YNL283C 1512 nt11.76□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 AHT1YHR093W 549 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 TAD3YLR316C 969 nt11.74□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 SEC11YIR022W 504 nt11.73□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 FTR1YER145C 1215 nt11.71□□□□□ -0.53
CTF3Q12748 YFR018CYFR018C 1092 nt11.7□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 TAT1YBR069C 1860 nt11.7□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 GAL1YBR020W 1587 nt11.68□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 AQY1YPR192W 918 nt11.66□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 TRM5YHR070W 1500 nt11.65□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 PRE6YOL038W 765 nt11.65□□□□□ -0.54
CTF3Q12748 PAU16YKL224C 372 nt11.64□□□□□ -0.55
CTF3Q12748 PCH2YBR186W 1695 nt11.64□□□□□ -0.55
CTF3Q12748 RRT5YFR032C 870 nt11.61□□□□□ -0.55
CTF3Q12748 ATF2YGR177C 1608 nt11.59□□□□□ -0.55
CTF3Q12748 STB1YNL309W 1263 nt11.58□□□□□ -0.56
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