Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 SIS1YNL007C 1059 nt10.93□□□□□ -0.66
RRI1Q12468 NPL3YDR432W 1245 nt10.9□□□□□ -0.66
RRI1Q12468 YDL221WYDL221W 552 nt10.87□□□□□ -0.67
RRI1Q12468 SDH1YKL148C 1923 nt10.87□□□□□ -0.67
RRI1Q12468 PTP1YDL230W 1008 nt10.85□□□□□ -0.67
RRI1Q12468 YOR139CYOR139C 393 nt10.83□□□□□ -0.68
RRI1Q12468 PCH2YBR186W 1695 nt10.78□□□□□ -0.68
RRI1Q12468 CAC2YML102W 1407 nt10.76□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 YCH1YGR203W 447 nt10.76□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 NVJ2YPR091C 2313 nt10.75□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 SEC11YIR022W 504 nt10.75□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 GUT2YIL155C 1950 nt10.74□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 PET9YBL030C 957 nt10.73□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 ART5YGR068C 1761 nt10.72□□□□□ -0.69
RRI1Q12468 SCC4YER147C 1875 nt10.7□□□□□ -0.7
RRI1Q12468 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.7□□□□□ -0.7
RRI1Q12468 GFD2YCL036W 1701 nt10.68□□□□□ -0.7
RRI1Q12468 YJL152WYJL152W 360 nt10.66□□□□□ -0.7
RRI1Q12468 TIR4YOR009W 1464 nt10.65□□□□□ -0.7
RRI1Q12468 YLR281CYLR281C 468 nt10.63□□□□□ -0.71
RRI1Q12468 WHI5YOR083W 888 nt10.63□□□□□ -0.71
RRI1Q12468 IRC15YPL017C 1500 nt10.62□□□□□ -0.71
RRI1Q12468 FPS1YLL043W 2010 nt10.6□□□□□ -0.71
RRI1Q12468 YMR057CYMR057C 372 nt10.57□□□□□ -0.72
RRI1Q12468 GIS3YLR094C 1509 nt10.57□□□□□ -0.72
RRI1Q12468 RTS2YOR077W 699 nt10.56□□□□□ -0.72
RRI1Q12468 PIB2YGL023C 1908 nt10.53□□□□□ -0.72
RRI1Q12468 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.53□□□□□ -0.72
RRI1Q12468 CUE1YMR264W 612 nt10.52□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 YSC84YHR016C 1407 nt10.51□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IMP2'YIL154C 1041 nt10.51□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 PUS2YGL063W 1113 nt10.49□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 YIL100WYIL100W 354 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 IDH1YNL037C 1083 nt10.46□□□□□ -0.73
RRI1Q12468 RTF1YGL244W 1677 nt10.46□□□□□ -0.74
RRI1Q12468 YJL225CYJL225C 5277 nt10.46□□□□□ -0.74
RRI1Q12468 YLR236CYLR236C 324 nt10.45□□□□□ -0.74
RRI1Q12468 YHL050CYHL050C 2094 nt10.44□□□□□ -0.74
RRI1Q12468 DSK2YMR276W 1122 nt10.41□□□□□ -0.74
RRI1Q12468 YNL195CYNL195C 786 nt10.39□□□□□ -0.75
RRI1Q12468 BOP3YNL042W 1191 nt10.37□□□□□ -0.75
RRI1Q12468 GBP2YCL011C 1284 nt10.35□□□□□ -0.75
RRI1Q12468 RRT12YCR045C 1476 nt10.35□□□□□ -0.75
RRI1Q12468 MOT3YMR070W 1473 nt10.34□□□□□ -0.75
RRI1Q12468 PTK1YKL198C 1989 nt10.3□□□□□ -0.76
RRI1Q12468 TCD2YKL027W 1344 nt10.29□□□□□ -0.76
RRI1Q12468 YDR433WYDR433W 441 nt10.25□□□□□ -0.77
RRI1Q12468 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.24□□□□□ -0.77
RRI1Q12468 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.24□□□□□ -0.77
RRI1Q12468 FMP45YDL222C 930 nt10.22□□□□□ -0.77
RRI1Q12468 FMP52YER004W 696 nt10.2□□□□□ -0.78
RRI1Q12468 YPR011CYPR011C 981 nt10.2□□□□□ -0.78
RRI1Q12468 RRD1YIL153W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
RRI1Q12468 ERV46YAL042W 1248 nt10.19□□□□□ -0.78
RRI1Q12468 YKR040CYKR040C 504 nt10.15□□□□□ -0.78
RRI1Q12468 BOR1YNL275W 1731 nt10.13□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 DED1YOR204W 1815 nt10.13□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 LPX1YOR084W 1164 nt10.13□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 NCP1YHR042W 2076 nt10.12□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 MXR2YCL033C 507 nt10.11□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 YCL042WYCL042W 360 nt10.09□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 YFL054CYFL054C 1941 nt10.09□□□□□ -0.79
RRI1Q12468 SOR2YDL246C 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 SOR1YJR159W 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 PCM1YEL058W 1674 nt10.03□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 SPT8YLR055C 1809 nt10.03□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 CWP1YKL096W 720 nt10.03□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 FMT1YBL013W 1206 nt10.03□□□□□ -0.8
RRI1Q12468 SNF6YHL025W 999 nt10.01□□□□□ -0.81
RRI1Q12468 ADH2YMR303C 1047 nt9.99□□□□□ -0.81
RRI1Q12468 FRD1YEL047C 1413 nt9.97□□□□□ -0.81
RRI1Q12468 UME6YDR207C 2511 nt9.96□□□□□ -0.82
RRI1Q12468 SIM1YIL123W 1431 nt9.95□□□□□ -0.82
RRI1Q12468 LCB1YMR296C 1677 nt9.91□□□□□ -0.82
RRI1Q12468 YIH1YCR059C 777 nt9.87□□□□□ -0.83
RRI1Q12468 BIO4YNR057C 714 nt9.86□□□□□ -0.83
RRI1Q12468 RNQ1YCL028W 1218 nt9.86□□□□□ -0.83
RRI1Q12468 YLR235CYLR235C 399 nt9.83□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 HSP60YLR259C 1719 nt9.82□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 SPP1YPL138C 1062 nt9.82□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 SWE1YJL187C 2460 nt9.81□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 DIC1YLR348C 897 nt9.81□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 ERF2YLR246W 1080 nt9.8□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 YLL053CYLL053C 459 nt9.78□□□□□ -0.84
RRI1Q12468 PTH1YHR189W 573 nt9.77□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 ALG12YNR030W 1656 nt9.75□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 FTR1YER145C 1215 nt9.72□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 YFL067WYFL067W 528 nt9.72□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 YKL030WYKL030W 606 nt9.72□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 TIM23YNR017W 669 nt9.72□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 AQY1YPR192W 918 nt9.72□□□□□ -0.85
RRI1Q12468 CRR1YLR213C 1269 nt9.71□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 MCH5YOR306C 1566 nt9.71□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 GLK1YCL040W 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 LYS4YDR234W 2082 nt9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.4 ms