Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.67□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.67□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.67□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 SEM1YDR363W-A 270 nt14.65□□□□□ -0.06
ARP8Q12386 PHO4YFR034C 939 nt14.64□□□□□ -0.07
ARP8Q12386 SPT5YML010W 3192 nt14.61□□□□□ -0.07
ARP8Q12386 BDH2YAL061W 1254 nt14.59□□□□□ -0.07
ARP8Q12386 YBL100CYBL100C 315 nt14.57□□□□□ -0.08
ARP8Q12386 VAR1Q0140 1197 nt14.53□□□□□ -0.08 RIP-Chip
ARP8Q12386 ARP10YDR106W 855 nt14.51□□□□□ -0.09
ARP8Q12386 LCP5YER127W 1074 nt14.49□□□□□ -0.09
ARP8Q12386 RKM5YLR137W 1104 nt14.49□□□□□ -0.09
ARP8Q12386 TOM20YGR082W 552 nt14.46□□□□□ -0.09
ARP8Q12386 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.42□□□□□ -0.1
ARP8Q12386 FUN26YAL022C 1554 nt14.4□□□□□ -0.1 RIP-Chip
ARP8Q12386 YPS1YLR120C 1710 nt14.39□□□□□ -0.11
ARP8Q12386 PUS2YGL063W 1113 nt14.39□□□□□ -0.11
ARP8Q12386 URH1YDR400W 1023 nt14.35□□□□□ -0.11
ARP8Q12386 LSM3YLR438C-A 270 nt14.34□□□□□ -0.11
ARP8Q12386 YLR281CYLR281C 468 nt14.32□□□□□ -0.12
ARP8Q12386 TRM9YML014W 840 nt14.31□□□□□ -0.12
ARP8Q12386 MEP2YNL142W 1500 nt14.27□□□□□ -0.12
ARP8Q12386 YDR095CYDR095C 411 nt14.27□□□□□ -0.13
ARP8Q12386 UTP6YDR449C 1323 nt14.24□□□□□ -0.13
ARP8Q12386 AI5_BETAQ0075 1065 nt14.23□□□□□ -0.13 RIP-Chip
ARP8Q12386 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.22□□□□□ -0.13
ARP8Q12386 CCT6YDR188W 1641 nt14.2□□□□□ -0.14
ARP8Q12386 WHI5YOR083W 888 nt14.18□□□□□ -0.14
ARP8Q12386 ALF1YNL148C 765 nt14.17□□□□□ -0.14
ARP8Q12386 PET20YPL159C 762 nt14.13□□□□□ -0.15
ARP8Q12386 MRPL8YJL063C 717 nt14.12□□□□□ -0.15
ARP8Q12386 DCW1YKL046C 1350 nt14.11□□□□□ -0.15
ARP8Q12386 YJL118WYJL118W 660 nt14.11□□□□□ -0.15
ARP8Q12386 SSA4YER103W 1929 nt14.08□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 YPL071CYPL071C 471 nt14.08□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 YCR099CYCR099C 468 nt14.07□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 HMT1YBR034C 1047 nt14.05□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 snR78snR78 87 nt14.03□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 FMP45YDL222C 930 nt14.03□□□□□ -0.16
ARP8Q12386 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.02□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.02□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt14.02□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 PTP1YDL230W 1008 nt14.01□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 SKG1YKR100C 1068 nt14.01□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 IMP2'YIL154C 1041 nt14□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 YMR057CYMR057C 372 nt14□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 SIS1YNL007C 1059 nt14□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 RPP2AYOL039W 321 nt14□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 DSK2YMR276W 1122 nt13.99□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 YCH1YGR203W 447 nt13.96□□□□□ -0.17
ARP8Q12386 CAC2YML102W 1407 nt13.93□□□□□ -0.18
ARP8Q12386 AI3Q0060 1248 nt13.92□□□□□ -0.18 RIP-Chip
ARP8Q12386 ADO1YJR105W 1023 nt13.91□□□□□ -0.18
ARP8Q12386 YHM2YMR241W 945 nt13.91□□□□□ -0.18
ARP8Q12386 YNR068CYNR068C 819 nt13.88□□□□□ -0.19
ARP8Q12386 EMI2YDR516C 1503 nt13.88□□□□□ -0.19
ARP8Q12386 ART5YGR068C 1761 nt13.84□□□□□ -0.19
ARP8Q12386 YJR154WYJR154W 1041 nt13.84□□□□□ -0.19
ARP8Q12386 YLR236CYLR236C 324 nt13.82□□□□□ -0.2
ARP8Q12386 YPR011CYPR011C 981 nt13.81□□□□□ -0.2
ARP8Q12386 TIR4YOR009W 1464 nt13.8□□□□□ -0.2
ARP8Q12386 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.79□□□□□ -0.2
ARP8Q12386 GFD2YCL036W 1701 nt13.78□□□□□ -0.2
ARP8Q12386 YDL221WYDL221W 552 nt13.77□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.73□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 YEL076CYEL076C 651 nt13.73□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 YLR464WYLR464W 651 nt13.73□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 IRC15YPL017C 1500 nt13.71□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 YJL152WYJL152W 360 nt13.71□□□□□ -0.21
ARP8Q12386 PET9YBL030C 957 nt13.69□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 URE2YNL229C 1065 nt13.69□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 UBX6YJL048C 1191 nt13.68□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 YMR090WYMR090W 684 nt13.68□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 RTS2YOR077W 699 nt13.67□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 YPL041CYPL041C 624 nt13.66□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 YBR220CYBR220C 1683 nt13.65□□□□□ -0.22
ARP8Q12386 YPL168WYPL168W 1293 nt13.64□□□□□ -0.23
ARP8Q12386 FTH1YBR207W 1398 nt13.61□□□□□ -0.23
ARP8Q12386 SDH1YKL148C 1923 nt13.61□□□□□ -0.23
ARP8Q12386 GIS3YLR094C 1509 nt13.6□□□□□ -0.23
ARP8Q12386 ERV46YAL042W 1248 nt13.58□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 PAB1YER165W 1734 nt13.56□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 LPX1YOR084W 1164 nt13.56□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 BDF1YLR399C 2061 nt13.55□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 COG1YGL223C 1254 nt13.54□□□□□ -0.24 RIP-Chip
ARP8Q12386 IDH1YNL037C 1083 nt13.53□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 SCC4YER147C 1875 nt13.53□□□□□ -0.24
ARP8Q12386 YJL107CYJL107C 1164 nt13.52□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 RTG1YOL067C 534 nt13.52□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 THP3YPR045C 1413 nt13.52□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 FPS1YLL043W 2010 nt13.49□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 SPP1YPL138C 1062 nt13.48□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 FTR1YER145C 1215 nt13.46□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 CUE1YMR264W 612 nt13.46□□□□□ -0.25
ARP8Q12386 Q0142Q0142 177 nt13.45□□□□□ -0.26
ARP8Q12386 YDR433WYDR433W 441 nt13.43□□□□□ -0.26
ARP8Q12386 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.43□□□□□ -0.26
ARP8Q12386 YEL074WYEL074W 339 nt13.41□□□□□ -0.26
ARP8Q12386 HUA1YGR268C 597 nt13.41□□□□□ -0.26
ARP8Q12386 YKR040CYKR040C 504 nt13.41□□□□□ -0.26
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