Protein–RNA interactions for Protein: Q12372

MMP1, S-methylmethionine permease 1, yeastyeast

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMP1Q12372 YPS1YLR120C 1710 nt11.78□□□□□ -0.52
MMP1Q12372 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.76□□□□□ -0.53
MMP1Q12372 RKM5YLR137W 1104 nt11.76□□□□□ -0.53
MMP1Q12372 SRN2YLR119W 642 nt11.75□□□□□ -0.53
MMP1Q12372 TOM20YGR082W 552 nt11.74□□□□□ -0.53
MMP1Q12372 URH1YDR400W 1023 nt11.71□□□□□ -0.53
MMP1Q12372 YDR095CYDR095C 411 nt11.7□□□□□ -0.54
MMP1Q12372 TRM9YML014W 840 nt11.69□□□□□ -0.54
MMP1Q12372 CCT6YDR188W 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
MMP1Q12372 MEP2YNL142W 1500 nt11.65□□□□□ -0.54
MMP1Q12372 YOL037CYOL037C 354 nt11.62□□□□□ -0.55
MMP1Q12372 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.59□□□□□ -0.55
MMP1Q12372 YJR154WYJR154W 1041 nt11.59□□□□□ -0.55
MMP1Q12372 NPL3YDR432W 1245 nt11.58□□□□□ -0.56
MMP1Q12372 FPS1YLL043W 2010 nt11.54□□□□□ -0.56
MMP1Q12372 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.53□□□□□ -0.56
MMP1Q12372 PTP1YDL230W 1008 nt11.52□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 YJL118WYJL118W 660 nt11.51□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 SIS1YNL007C 1059 nt11.51□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 ALF1YNL148C 765 nt11.5□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 DCW1YKL046C 1350 nt11.5□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 SSA4YER103W 1929 nt11.47□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.46□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.46□□□□□ -0.57
MMP1Q12372 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.58
MMP1Q12372 RPP2AYOL039W 321 nt11.44□□□□□ -0.58
MMP1Q12372 YLR281CYLR281C 468 nt11.42□□□□□ -0.58
MMP1Q12372 YDR509WYDR509W 348 nt11.41□□□□□ -0.58
MMP1Q12372 CAC2YML102W 1407 nt11.4□□□□□ -0.58
MMP1Q12372 NVJ2YPR091C 2313 nt11.4□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 ARP10YDR106W 855 nt11.39□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.38□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.38□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.38□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.38□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.38□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 YMR057CYMR057C 372 nt11.36□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 WHI5YOR083W 888 nt11.35□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 SEM1YDR363W-A 270 nt11.34□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.34□□□□□ -0.59
MMP1Q12372 PAB1YER165W 1734 nt11.33□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.33□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 HMT1YBR034C 1047 nt11.33□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 UTP6YDR449C 1323 nt11.32□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 TIR4YOR009W 1464 nt11.32□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 ART5YGR068C 1761 nt11.31□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 EMI2YDR516C 1503 nt11.3□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 GFD2YCL036W 1701 nt11.29□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 YCH1YGR203W 447 nt11.28□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 YHM2YMR241W 945 nt11.28□□□□□ -0.6
MMP1Q12372 Q0144Q0144 330 nt11.27□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 YPL071CYPL071C 471 nt11.26□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 YDL221WYDL221W 552 nt11.24□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 IRC15YPL017C 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 PUS2YGL063W 1113 nt11.23□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 PET9YBL030C 957 nt11.23□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 YPL041CYPL041C 624 nt11.22□□□□□ -0.61
MMP1Q12372 YPR011CYPR011C 981 nt11.2□□□□□ -0.62
MMP1Q12372 COG1YGL223C 1254 nt11.19□□□□□ -0.62
MMP1Q12372 FTH1YBR207W 1398 nt11.18□□□□□ -0.62
MMP1Q12372 YBR220CYBR220C 1683 nt11.16□□□□□ -0.62
MMP1Q12372 YLR236CYLR236C 324 nt11.15□□□□□ -0.62
MMP1Q12372 YJL152WYJL152W 360 nt11.13□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 BDF1YLR399C 2061 nt11.12□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 SDH1YKL148C 1923 nt11.11□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 GIS3YLR094C 1509 nt11.11□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 YMR090WYMR090W 684 nt11.1□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 DSK2YMR276W 1122 nt11.09□□□□□ -0.63
MMP1Q12372 RTS2YOR077W 699 nt11.08□□□□□ -0.64
MMP1Q12372 IMP2'YIL154C 1041 nt11.06□□□□□ -0.64
MMP1Q12372 SKG1YKR100C 1068 nt11.06□□□□□ -0.64
MMP1Q12372 PET20YPL159C 762 nt11.03□□□□□ -0.64
MMP1Q12372 SCC4YER147C 1875 nt11.03□□□□□ -0.64
MMP1Q12372 CUE1YMR264W 612 nt11.02□□□□□ -0.65
MMP1Q12372 snR78snR78 87 nt11□□□□□ -0.65
MMP1Q12372 YTH1YPR107C 627 nt10.99□□□□□ -0.65
MMP1Q12372 IDH1YNL037C 1083 nt10.96□□□□□ -0.65
MMP1Q12372 FMP45YDL222C 930 nt10.95□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 ERV46YAL042W 1248 nt10.95□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 TAT1YBR069C 1860 nt10.94□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 YCR099CYCR099C 468 nt10.93□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 BNS1YGR230W 414 nt10.93□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 STB1YNL309W 1263 nt10.93□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 LPX1YOR084W 1164 nt10.92□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.92□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 DED1YOR204W 1815 nt10.92□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 RRD1YIL153W 1182 nt10.91□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 GBP2YCL011C 1284 nt10.91□□□□□ -0.66
MMP1Q12372 FRE6YLL051C 2139 nt10.89□□□□□ -0.67
MMP1Q12372 PUS5YLR165C 765 nt10.84□□□□□ -0.67
MMP1Q12372 MXR2YCL033C 507 nt10.84□□□□□ -0.67
MMP1Q12372 YDR433WYDR433W 441 nt10.82□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 YKR040CYKR040C 504 nt10.82□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 FMT1YBL013W 1206 nt10.82□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 REC114YMR133W 1287 nt10.82□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 YJL107CYJL107C 1164 nt10.81□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 YNR068CYNR068C 819 nt10.8□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 ATG17YLR423C 1254 nt10.79□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 YHL050CYHL050C 2094 nt10.79□□□□□ -0.68
MMP1Q12372 TCD2YKL027W 1344 nt10.78□□□□□ -0.68
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