Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 SIS1YNL007C 1059 nt14□□□□□ -0.17
CLF1Q12309 IMP2'YIL154C 1041 nt13.97□□□□□ -0.17
CLF1Q12309 DSK2YMR276W 1122 nt13.97□□□□□ -0.17
CLF1Q12309 RPP2AYOL039W 321 nt13.95□□□□□ -0.18
CLF1Q12309 MEP2YNL142W 1500 nt13.95□□□□□ -0.18
CLF1Q12309 FMP45YDL222C 930 nt13.88□□□□□ -0.19
CLF1Q12309 SPT5YML010W 3192 nt13.83□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 YLR236CYLR236C 324 nt13.83□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 MOT3YMR070W 1473 nt13.82□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 TIR4YOR009W 1464 nt13.81□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 IDH1YNL037C 1083 nt13.81□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 YPR011CYPR011C 981 nt13.8□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 YCH1YGR203W 447 nt13.79□□□□□ -0.2
CLF1Q12309 PTP1YDL230W 1008 nt13.77□□□□□ -0.21
CLF1Q12309 ART5YGR068C 1761 nt13.77□□□□□ -0.21
CLF1Q12309 PET9YBL030C 957 nt13.74□□□□□ -0.21
CLF1Q12309 DCW1YKL046C 1350 nt13.71□□□□□ -0.21
CLF1Q12309 YMR057CYMR057C 372 nt13.69□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.68□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 YDR433WYDR433W 441 nt13.67□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 GFD2YCL036W 1701 nt13.67□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 CAC2YML102W 1407 nt13.66□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 GBP2YCL011C 1284 nt13.66□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 Q0182Q0182 405 nt13.65□□□□□ -0.22
CLF1Q12309 LPX1YOR084W 1164 nt13.62□□□□□ -0.23
CLF1Q12309 ERV46YAL042W 1248 nt13.6□□□□□ -0.23
CLF1Q12309 EMI2YDR516C 1503 nt13.59□□□□□ -0.23
CLF1Q12309 YMR090WYMR090W 684 nt13.58□□□□□ -0.24
CLF1Q12309 SSA4YER103W 1929 nt13.58□□□□□ -0.24
CLF1Q12309 RTS2YOR077W 699 nt13.53□□□□□ -0.24
CLF1Q12309 YKR040CYKR040C 504 nt13.52□□□□□ -0.25
CLF1Q12309 YDL221WYDL221W 552 nt13.5□□□□□ -0.25
CLF1Q12309 TCD2YKL027W 1344 nt13.49□□□□□ -0.25
CLF1Q12309 MXR2YCL033C 507 nt13.47□□□□□ -0.25
CLF1Q12309 IRC15YPL017C 1500 nt13.43□□□□□ -0.26
CLF1Q12309 CUE1YMR264W 612 nt13.4□□□□□ -0.26
CLF1Q12309 SPP1YPL138C 1062 nt13.4□□□□□ -0.26
CLF1Q12309 FPS1YLL043W 2010 nt13.4□□□□□ -0.26
CLF1Q12309 GIS3YLR094C 1509 nt13.35□□□□□ -0.27
CLF1Q12309 MRPL8YJL063C 717 nt13.34□□□□□ -0.27
CLF1Q12309 YIL100WYIL100W 354 nt13.32□□□□□ -0.28
CLF1Q12309 RRD1YIL153W 1182 nt13.29□□□□□ -0.28
CLF1Q12309 SDH1YKL148C 1923 nt13.27□□□□□ -0.28
CLF1Q12309 SCC4YER147C 1875 nt13.26□□□□□ -0.29
CLF1Q12309 DED1YOR204W 1815 nt13.26□□□□□ -0.29
CLF1Q12309 ADO1YJR105W 1023 nt13.25□□□□□ -0.29
CLF1Q12309 YCL042WYCL042W 360 nt13.25□□□□□ -0.29
CLF1Q12309 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 YEL076CYEL076C 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 YLR464WYLR464W 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 YBR220CYBR220C 1683 nt13.2□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 FRD1YEL047C 1413 nt13.18□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 RTG1YOL067C 534 nt13.16□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 FMP52YER004W 696 nt13.15□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 BDF1YLR399C 2061 nt13.15□□□□□ -0.3
CLF1Q12309 FMT1YBL013W 1206 nt13.13□□□□□ -0.31
CLF1Q12309 SOR2YDL246C 1074 nt13.11□□□□□ -0.31
CLF1Q12309 SOR1YJR159W 1074 nt13.11□□□□□ -0.31
CLF1Q12309 CWP1YKL096W 720 nt13.1□□□□□ -0.31
CLF1Q12309 YNL195CYNL195C 786 nt13.1□□□□□ -0.31
CLF1Q12309 PTH1YHR189W 573 nt13.07□□□□□ -0.32
CLF1Q12309 HUA1YGR268C 597 nt13.06□□□□□ -0.32
CLF1Q12309 NVJ2YPR091C 2313 nt13.06□□□□□ -0.32
CLF1Q12309 YLR235CYLR235C 399 nt13.05□□□□□ -0.32
CLF1Q12309 ADH2YMR303C 1047 nt13.01□□□□□ -0.33
CLF1Q12309 YKL030WYKL030W 606 nt13□□□□□ -0.33
CLF1Q12309 SNF6YHL025W 999 nt12.96□□□□□ -0.33
CLF1Q12309 PCM1YEL058W 1674 nt12.95□□□□□ -0.34
CLF1Q12309 TAT1YBR069C 1860 nt12.94□□□□□ -0.34
CLF1Q12309 YSC84YHR016C 1407 nt12.89□□□□□ -0.35
CLF1Q12309 RRT12YCR045C 1476 nt12.89□□□□□ -0.35
CLF1Q12309 LCB1YMR296C 1677 nt12.89□□□□□ -0.35
CLF1Q12309 PAC11YDR488C 1602 nt12.88□□□□□ -0.35
CLF1Q12309 DIC1YLR348C 897 nt12.87□□□□□ -0.35
CLF1Q12309 TIM23YNR017W 669 nt12.83□□□□□ -0.36
CLF1Q12309 UBX6YJL048C 1191 nt12.81□□□□□ -0.36
CLF1Q12309 RNQ1YCL028W 1218 nt12.8□□□□□ -0.36
CLF1Q12309 YLR179CYLR179C 606 nt12.78□□□□□ -0.36
CLF1Q12309 YIH1YCR059C 777 nt12.77□□□□□ -0.37
CLF1Q12309 SEC11YIR022W 504 nt12.77□□□□□ -0.37
CLF1Q12309 YHL050CYHL050C 2094 nt12.77□□□□□ -0.37
CLF1Q12309 SIM1YIL123W 1431 nt12.73□□□□□ -0.37
CLF1Q12309 YDR094WYDR094W 336 nt12.71□□□□□ -0.37
CLF1Q12309 YPR064WYPR064W 420 nt12.7□□□□□ -0.38
CLF1Q12309 BIO4YNR057C 714 nt12.68□□□□□ -0.38
CLF1Q12309 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.67□□□□□ -0.38
CLF1Q12309 YLL053CYLL053C 459 nt12.67□□□□□ -0.38
CLF1Q12309 AQY1YPR192W 918 nt12.6□□□□□ -0.39
CLF1Q12309 PCH2YBR186W 1695 nt12.6□□□□□ -0.39
CLF1Q12309 FTR1YER145C 1215 nt12.59□□□□□ -0.39
CLF1Q12309 TAD3YLR316C 969 nt12.59□□□□□ -0.39
CLF1Q12309 AHT1YHR093W 549 nt12.56□□□□□ -0.4
CLF1Q12309 GAL1YBR020W 1587 nt12.55□□□□□ -0.4
CLF1Q12309 WSC2YNL283C 1512 nt12.54□□□□□ -0.4
CLF1Q12309 TRM5YHR070W 1500 nt12.52□□□□□ -0.4
CLF1Q12309 ERF2YLR246W 1080 nt12.52□□□□□ -0.41
CLF1Q12309 DDR2YOL052C-A 186 nt12.51□□□□□ -0.41
CLF1Q12309 GUT2YIL155C 1950 nt12.49□□□□□ -0.41
CLF1Q12309 YFL067WYFL067W 528 nt12.48□□□□□ -0.41
CLF1Q12309 STB1YNL309W 1263 nt12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms