Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 SIS1YNL007C 1059 nt12.63□□□□□ -0.39
SVS1Q12254 IMP2'YIL154C 1041 nt12.6□□□□□ -0.39
SVS1Q12254 SPT5YML010W 3192 nt12.59□□□□□ -0.39
SVS1Q12254 DSK2YMR276W 1122 nt12.58□□□□□ -0.4
SVS1Q12254 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
SVS1Q12254 YJL152WYJL152W 360 nt12.56□□□□□ -0.4
SVS1Q12254 RPP2AYOL039W 321 nt12.56□□□□□ -0.4
SVS1Q12254 FMP45YDL222C 930 nt12.47□□□□□ -0.41
SVS1Q12254 YLR236CYLR236C 324 nt12.47□□□□□ -0.41
SVS1Q12254 YPR011CYPR011C 981 nt12.46□□□□□ -0.41
SVS1Q12254 MOT3YMR070W 1473 nt12.46□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 TIR4YOR009W 1464 nt12.45□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 PTP1YDL230W 1008 nt12.44□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 YCH1YGR203W 447 nt12.42□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 IDH1YNL037C 1083 nt12.41□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 ART5YGR068C 1761 nt12.4□□□□□ -0.42
SVS1Q12254 PET9YBL030C 957 nt12.38□□□□□ -0.43
SVS1Q12254 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
SVS1Q12254 GFD2YCL036W 1701 nt12.32□□□□□ -0.44
SVS1Q12254 CAC2YML102W 1407 nt12.3□□□□□ -0.44
SVS1Q12254 YMR057CYMR057C 372 nt12.3□□□□□ -0.44
SVS1Q12254 ERV46YAL042W 1248 nt12.28□□□□□ -0.44
SVS1Q12254 GBP2YCL011C 1284 nt12.27□□□□□ -0.45
SVS1Q12254 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.27□□□□□ -0.45
SVS1Q12254 YDR433WYDR433W 441 nt12.26□□□□□ -0.45
SVS1Q12254 LPX1YOR084W 1164 nt12.26□□□□□ -0.45
SVS1Q12254 EMI2YDR516C 1503 nt12.24□□□□□ -0.45
SVS1Q12254 YMR090WYMR090W 684 nt12.19□□□□□ -0.46
SVS1Q12254 YKR040CYKR040C 504 nt12.18□□□□□ -0.46
SVS1Q12254 YDL221WYDL221W 552 nt12.17□□□□□ -0.46
SVS1Q12254 RTS2YOR077W 699 nt12.14□□□□□ -0.47
SVS1Q12254 TCD2YKL027W 1344 nt12.11□□□□□ -0.47
SVS1Q12254 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
SVS1Q12254 MXR2YCL033C 507 nt12.11□□□□□ -0.47
SVS1Q12254 FPS1YLL043W 2010 nt12.1□□□□□ -0.47
SVS1Q12254 SSA4YER103W 1929 nt12.08□□□□□ -0.48
SVS1Q12254 CUE1YMR264W 612 nt12.07□□□□□ -0.48
SVS1Q12254 MRPL8YJL063C 717 nt12.06□□□□□ -0.48
SVS1Q12254 SPP1YPL138C 1062 nt12.06□□□□□ -0.48
SVS1Q12254 GIS3YLR094C 1509 nt12.02□□□□□ -0.48
SVS1Q12254 RRD1YIL153W 1182 nt11.99□□□□□ -0.49
SVS1Q12254 DED1YOR204W 1815 nt11.98□□□□□ -0.49
SVS1Q12254 SDH1YKL148C 1923 nt11.98□□□□□ -0.49
SVS1Q12254 YIL100WYIL100W 354 nt11.95□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 SCC4YER147C 1875 nt11.95□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 ADO1YJR105W 1023 nt11.94□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 YBR220CYBR220C 1683 nt11.92□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.91□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 YEL076CYEL076C 651 nt11.91□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 YLR464WYLR464W 651 nt11.91□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 RTG1YOL067C 534 nt11.91□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 FRD1YEL047C 1413 nt11.9□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 YCL042WYCL042W 360 nt11.9□□□□□ -0.5
SVS1Q12254 FMP52YER004W 696 nt11.86□□□□□ -0.51
SVS1Q12254 SOR2YDL246C 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
SVS1Q12254 SOR1YJR159W 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
SVS1Q12254 FMT1YBL013W 1206 nt11.85□□□□□ -0.51
SVS1Q12254 BDF1YLR399C 2061 nt11.77□□□□□ -0.52
SVS1Q12254 HUA1YGR268C 597 nt11.75□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 CWP1YKL096W 720 nt11.75□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 YLR235CYLR235C 399 nt11.75□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 YNL195CYNL195C 786 nt11.75□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 PTH1YHR189W 573 nt11.74□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 ADH2YMR303C 1047 nt11.71□□□□□ -0.53
SVS1Q12254 YKL030WYKL030W 606 nt11.69□□□□□ -0.54
SVS1Q12254 PCM1YEL058W 1674 nt11.66□□□□□ -0.54
SVS1Q12254 SNF6YHL025W 999 nt11.66□□□□□ -0.54
SVS1Q12254 RRT12YCR045C 1476 nt11.61□□□□□ -0.55
SVS1Q12254 YSC84YHR016C 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
SVS1Q12254 PAC11YDR488C 1602 nt11.6□□□□□ -0.55
SVS1Q12254 LCB1YMR296C 1677 nt11.6□□□□□ -0.55
SVS1Q12254 DIC1YLR348C 897 nt11.58□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 TAT1YBR069C 1860 nt11.57□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 UBX6YJL048C 1191 nt11.55□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 TIM23YNR017W 669 nt11.55□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 RNQ1YCL028W 1218 nt11.54□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 YHL050CYHL050C 2094 nt11.54□□□□□ -0.56
SVS1Q12254 YIH1YCR059C 777 nt11.52□□□□□ -0.57
SVS1Q12254 SEC11YIR022W 504 nt11.52□□□□□ -0.57
SVS1Q12254 YDR094WYDR094W 336 nt11.49□□□□□ -0.57
SVS1Q12254 YLR179CYLR179C 606 nt11.48□□□□□ -0.57
SVS1Q12254 SIM1YIL123W 1431 nt11.44□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 BIO4YNR057C 714 nt11.43□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 YPR064WYPR064W 420 nt11.42□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.41□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 YLL053CYLL053C 459 nt11.41□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 NVJ2YPR091C 2313 nt11.41□□□□□ -0.58
SVS1Q12254 PCH2YBR186W 1695 nt11.36□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 FTR1YER145C 1215 nt11.35□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 AHT1YHR093W 549 nt11.35□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 TAD3YLR316C 969 nt11.35□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 AQY1YPR192W 918 nt11.35□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 WSC2YNL283C 1512 nt11.34□□□□□ -0.59
SVS1Q12254 GAL1YBR020W 1587 nt11.31□□□□□ -0.6
SVS1Q12254 GUT2YIL155C 1950 nt11.28□□□□□ -0.6
SVS1Q12254 TRM5YHR070W 1500 nt11.27□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 ERF2YLR246W 1080 nt11.27□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 YFR018CYFR018C 1092 nt11.26□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 YFL067WYFL067W 528 nt11.23□□□□□ -0.61
SVS1Q12254 DDR2YOL052C-A 186 nt11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms