Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 YOR139CYOR139C 393 nt11.83□□□□□ -0.52
RPN5Q12250 NPL3YDR432W 1245 nt11.79□□□□□ -0.52
RPN5Q12250 YBR220CYBR220C 1683 nt11.76□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 ART5YGR068C 1761 nt11.75□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 YCH1YGR203W 447 nt11.74□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 PET9YBL030C 957 nt11.74□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 BDF1YLR399C 2061 nt11.73□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 GFD2YCL036W 1701 nt11.73□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 SDH1YKL148C 1923 nt11.71□□□□□ -0.53
RPN5Q12250 IRC15YPL017C 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
RPN5Q12250 MOT3YMR070W 1473 nt11.69□□□□□ -0.54
RPN5Q12250 TIR4YOR009W 1464 nt11.68□□□□□ -0.54
RPN5Q12250 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.67□□□□□ -0.54
RPN5Q12250 SCC4YER147C 1875 nt11.61□□□□□ -0.55
RPN5Q12250 GIS3YLR094C 1509 nt11.61□□□□□ -0.55
RPN5Q12250 YLR281CYLR281C 468 nt11.6□□□□□ -0.55
RPN5Q12250 TAT1YBR069C 1860 nt11.59□□□□□ -0.55
RPN5Q12250 WHI5YOR083W 888 nt11.57□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 YJL152WYJL152W 360 nt11.56□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 YMR057CYMR057C 372 nt11.56□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 RTS2YOR077W 699 nt11.56□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 PAC11YDR488C 1602 nt11.55□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 CUE1YMR264W 612 nt11.53□□□□□ -0.56
RPN5Q12250 NVJ2YPR091C 2313 nt11.51□□□□□ -0.57
RPN5Q12250 FPS1YLL043W 2010 nt11.46□□□□□ -0.57
RPN5Q12250 SEC11YIR022W 504 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 YJL225CYJL225C 5277 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 IMP2'YIL154C 1041 nt11.4□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 YLR236CYLR236C 324 nt11.4□□□□□ -0.58
RPN5Q12250 PUS2YGL063W 1113 nt11.39□□□□□ -0.59
RPN5Q12250 YIL100WYIL100W 354 nt11.39□□□□□ -0.59
RPN5Q12250 IDH1YNL037C 1083 nt11.36□□□□□ -0.59
RPN5Q12250 YSC84YHR016C 1407 nt11.33□□□□□ -0.6
RPN5Q12250 DSK2YMR276W 1122 nt11.32□□□□□ -0.6
RPN5Q12250 PCH2YBR186W 1695 nt11.32□□□□□ -0.6
RPN5Q12250 YNL195CYNL195C 786 nt11.3□□□□□ -0.6
RPN5Q12250 GBP2YCL011C 1284 nt11.27□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 YHL050CYHL050C 2094 nt11.27□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 GUT2YIL155C 1950 nt11.26□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 RRT12YCR045C 1476 nt11.25□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.22□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.22□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 YPR011CYPR011C 981 nt11.21□□□□□ -0.61
RPN5Q12250 RRD1YIL153W 1182 nt11.2□□□□□ -0.62
RPN5Q12250 TCD2YKL027W 1344 nt11.18□□□□□ -0.62
RPN5Q12250 FMP52YER004W 696 nt11.14□□□□□ -0.63
RPN5Q12250 DED1YOR204W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
RPN5Q12250 FMP45YDL222C 930 nt11.13□□□□□ -0.63
RPN5Q12250 YDR433WYDR433W 441 nt11.13□□□□□ -0.63
RPN5Q12250 ERV46YAL042W 1248 nt11.12□□□□□ -0.63
RPN5Q12250 PIB2YGL023C 1908 nt11.07□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 YKR040CYKR040C 504 nt11.06□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 RTF1YGL244W 1677 nt11.05□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 LPX1YOR084W 1164 nt11.05□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 FMT1YBL013W 1206 nt11.04□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 BOP3YNL042W 1191 nt11.04□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 MXR2YCL033C 507 nt11.03□□□□□ -0.64
RPN5Q12250 SOR2YDL246C 1074 nt11□□□□□ -0.65
RPN5Q12250 SOR1YJR159W 1074 nt11□□□□□ -0.65
RPN5Q12250 PCM1YEL058W 1674 nt10.99□□□□□ -0.65
RPN5Q12250 NCP1YHR042W 2076 nt10.98□□□□□ -0.65
RPN5Q12250 YCL042WYCL042W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 CWP1YKL096W 720 nt10.94□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 ADH2YMR303C 1047 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 FRD1YEL047C 1413 nt10.92□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 LCB1YMR296C 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 SNF6YHL025W 999 nt10.91□□□□□ -0.66
RPN5Q12250 PTK1YKL198C 1989 nt10.88□□□□□ -0.67
RPN5Q12250 SIM1YIL123W 1431 nt10.87□□□□□ -0.67
RPN5Q12250 YIH1YCR059C 777 nt10.82□□□□□ -0.68
RPN5Q12250 BIO4YNR057C 714 nt10.82□□□□□ -0.68
RPN5Q12250 RNQ1YCL028W 1218 nt10.79□□□□□ -0.68
RPN5Q12250 SPP1YPL138C 1062 nt10.75□□□□□ -0.69
RPN5Q12250 ERF2YLR246W 1080 nt10.72□□□□□ -0.69
RPN5Q12250 LYS4YDR234W 2082 nt10.72□□□□□ -0.69
RPN5Q12250 YLL053CYLL053C 459 nt10.71□□□□□ -0.69
RPN5Q12250 DIC1YLR348C 897 nt10.7□□□□□ -0.7
RPN5Q12250 YLR235CYLR235C 399 nt10.68□□□□□ -0.7
RPN5Q12250 YFL054CYFL054C 1941 nt10.67□□□□□ -0.7
RPN5Q12250 CRR1YLR213C 1269 nt10.66□□□□□ -0.7
RPN5Q12250 FTR1YER145C 1215 nt10.64□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 PTH1YHR189W 573 nt10.63□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 YFL067WYFL067W 528 nt10.6□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 SPT8YLR055C 1809 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 AQY1YPR192W 918 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 GAL1YBR020W 1587 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN5Q12250 ATF2YGR177C 1608 nt10.58□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 UME6YDR207C 2511 nt10.58□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 TIM23YNR017W 669 nt10.58□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 YKL030WYKL030W 606 nt10.56□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 TRM5YHR070W 1500 nt10.56□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 HEM12YDR047W 1089 nt10.54□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 DDR2YOL052C-A 186 nt10.53□□□□□ -0.72
RPN5Q12250 RTG1YOL067C 534 nt10.53□□□□□ -0.72
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